Daily Journal Digest — 2026-08-28¶

過去 24 小時新增：Transplant ID × 30、One Health × 15、Food Security × 15，共 60 篇。

⭐ 今日亮點¶

Asian consensus on diagnostic algorithm for invasive pulmonary fungal diseases in high-burden settings
亞洲 IPFD 診斷框架，貼近臨床微生物落差。
Integrated diagnostic strategies for Pneumocystis pneumonia: bronchoalveolar lavage qPCR cycle threshold and serum β-D-glucan
免疫低下者 PCP 診斷決策可直接轉化。
Bidirectional Temporal Association Between Cytomegalovirus Reactivation and Graft-Versus-Host Disease Following Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation: A Single-Center Real-World Cohort Study
HSCT 核心併發症的雙向時間關聯。
VALID regimen of voriconazole optimizes therapeutic target attainment and minimizes adverse events in patients with liver dysfunction
肝功能異常抗黴菌給藥可操作
Real-World Effectiveness and Renal Safety of Foscarnet for CMV Reactivation After Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation
HSCT 後 CMV 用藥取捨的真實世界警訊

🔬 深入評讀¶

Asian consensus on diagnostic algorithm for invasive pulmonary fungal diseases in high-burden settings¶

J Transl Int Med | DOI | PMID 42657100

設計：這不是實證比較研究，而是 76 位跨感染科、重症、胸腔、檢驗醫學、醫學黴菌學與健康經濟學專家共同撰寫的亞洲共識；文獻搜尋涵蓋 Cochrane Library、Embase、PubMed，納入截至 2025 年 8 月的 IPFD 診斷文獻，並於 2026 年 8 月 26 日發表。共識聚焦亞洲高負擔場域，定義為 IPFD 發生率／死亡率高於全球平均、特定亞型局部高度流行，或診斷資源有限且分布不均的地區。
樣本：共識來自 18 個國家、76 位專家，經 2 輪面對面與線上討論後再以 email 審閱，達成共識門檻設為至少 75% 專家同意。涵蓋的關鍵病原包括高機率 IPFD 的 Aspergillus fumigatus、A. flavus、Cryptococcus neoformans species complex、Pneumocystis jirovecii，以及在特定亞洲區域需升級考量的 Mucorales、Talaromyces marneffei、Histoplasma、Emergomyces、Candida auris 等。
關鍵數字：核心建議是以 Day 0 到 2 週的時序化診斷流程，先依宿主因子、流行病學／暴露史與臨床影像把 IPFD 分為 high-probability 與 low-probability，再優先做 microscopy、culture、GM、GXM、BDG、pathogen-specific PCR，必要時升級 BALF、histopathology、mNGS／tNGS。可量化重點包括全球肺部黴菌感染每年約 5.62 million 新病例、超過 45,000 死亡，印度 mucormycosis 盛行率估計約為全球平均 70 倍，neutropenic IPA 死亡率超過 50%，而 endemic fungi culture 通常需 ≥4 週、可長達 6 週，顯示此演算法的效益主要在縮短延遲診斷，而非提供單一檢驗的強效 HR／OR 證據。
Limitation：主要限制是共識與診斷演算法，沒有原始 cohort、隨機分派、HR／OR／CI 或前瞻性驗證，也未提供各檢驗在亞洲不同場域的 pooled sensitivity／specificity。mNGS／tNGS 的平台、資料庫、cut-off、污染與 colonization 判讀仍未標準化，加上各國甚至同國內診斷資源差異很大，會限制演算法的外部可用性與一致執行。
Bottom line：臨床帶走訊息是：在亞洲高 TB、HIV、糖尿病與診斷資源不均的場域，疑似 IPFD 不應等單一檢驗定案，而要在 1–2 天內用宿主風險、區域病原譜與多重快速檢驗並行分層，避免把 IPA、PJP、cryptococcosis、mucormycosis 或 talaromycosis 延誤成 TB 或細菌性肺炎。

Integrated diagnostic strategies for Pneumocystis pneumonia: bronchoalveolar lavage qPCR cycle threshold and serum β-D-glucan¶

Clin Microbiol Infect | IF 8.0 | DOI | PMID 42648481

設計：這是瑞士日內瓦大學醫院於 2020 年 3 月至 2024 年 12 月進行的 retrospective diagnostic accuracy study，納入所有 BALF P. jirovecii qPCR 檢測 episode。PCP 狀態由專家小組依 EORTC/MSGERC 2020 criteria adjudicate，且對 Ct 結果盲法。
樣本：共 1,300 次 PCR 檢測中納入 774 個 BALF qPCR episode；68/774（8.8%）PCR 陽性，47/774（6.1%）被分類為 probable/proven PCP，28/774（3.6%）為 colonization。研究以 episode 為分析單位，未提供追蹤時間。
關鍵數字：BALF qPCR Ct 的診斷表現良好，AUC 0.85（95% CI 0.76–0.94），最佳 cutoff 30 時 sensitivity 0.73、specificity 0.87；qPCR 陰性 ruling out PCP 的 sensitivity 為 0.96（95% CI 0.85–0.99）。BDG 表現更佳，PCP 組 median 119 vs. 0 pg/mL，AUC 0.96（95% CI 0.93–1.00），cutoff 9 pg/mL 時 sensitivity 0.97、specificity 0.90；在 Ct 26–36 的灰區，BDG 9 pg/mL 可進一步區分 PCP 與 colonization（sensitivity 0.94、specificity 0.93）。
Limitation：主要限制是 retrospective、single-center、以 episode 而非病人為單位，且 PCP adjudication 雖盲於 Ct，但仍可能受臨床資訊與 PCR 結果影響。cutoff 來自同一資料集，尚需外部驗證；47 例 PCP 也讓部分估計仍有 imprecision。
Bottom line：BALF qPCR Ct 搭配 serum BDG 可把 PCP 診斷從單純陽性／陰性推進到 infection 與 colonization 的風險分層，特別適合免疫低下非 HIV 病人的臨床微生物判讀。
GRADE 證據等級：Very low ⊕◯◯◯

Bidirectional Temporal Association Between Cytomegalovirus Reactivation and Graft-Versus-Host Disease Following Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation: A Single-Center Real-World Cohort Study¶

Viruses | IF 4.0 | DOI | PMID 42655692

設計：單中心 retrospective real-world cohort，納入 2016 年 1 月至 2025 年 2 月接受 allo-HSCT 的成人血液惡性腫瘤病人；以 weekly quantitative CMV-DNA PCR 監測，採標準化 pre-emptive treatment strategy。研究用 day-100 landmark cohort，並以 time-dependent Cox regression 評估 CMV reactivation 與 GVHD 的時間先後關聯。
樣本：共分析 100 名成人 allo-HSCT 病人，排除移植後 100 天內 relapse 或死亡者；CMV reactivation 72 例，GVHD 51 例，兩者皆發生者中 CMV 先於 GVHD 為 32 例、GVHD 先於 CMV 為 14 例。摘要未提供完整追蹤時間。
關鍵數字：CMV reactivation 發生率 72%，median time to reactivation 為 37 天，CMV end-organ disease 發生於 CMV reactivation 病人的 13.9%。Time-dependent Cox 顯示 CMV reactivation 增加後續 GVHD 風險（HR 2.93，95% CI 1.51–5.69；p=0.001），GVHD 也增加後續 CMV reactivation 風險（HR 1.98，95% CI 1.06–3.71；p=0.032）；但依 CMV 或 GVHD 狀態分組，OS 與 RFS 無顯著差異。
Limitation：主要限制是單中心 retrospective 設計、樣本數小，且 day-100 landmark 排除早期 relapse 或死亡者，可能造成 survivor／selection bias。CMV、GVHD、免疫重建與治療暴露之間高度交互影響，殘餘 confounding 與 time-dependent confounding 仍難完全排除；本 cohort 未評估 letermovir prophylaxis，因此不能直接推論預防效益。
Bottom line：在未常規使用 letermovir、以 pre-emptive strategy 為主的 allo-HSCT 情境，CMV reactivation 與 GVHD 應被視為會互相放大的動態風險，而非兩個孤立事件。
GRADE 證據等級：Very low ⊕◯◯◯

VALID regimen of voriconazole optimizes therapeutic target attainment and minimizes adverse events in patients with liver dysfunction¶

Front Pharmacol | DOI | PMID 42656781

設計：這是 2020 年 1 月至 2023 年 12 月的觀察性、非介入研究，納入住院且臨床診斷有肝功能異常、接受 voriconazole 預防或治療 invasive fungal infection 的病人。研究依實際起始劑量分為 TBIL-based VALID regimen 與 clinician-directed control，並以 1:1 propensity score matching 校正基線差異，voriconazole trough 以 liquid chromatography 測量。
樣本：初始納入 182 位肝功能異常病人與 375 筆 trough concentration，其中 VALID 組 39 位、control 組 143 位；配對後兩組各 39 位。主要族群包含 liver cirrhosis 與 acute-on-chronic liver failure，abstract 未提供國家／地區與追蹤時間。
關鍵數字：配對後，VALID 組 initial target trough attainment 較高（89.7% vs. 48.7%，P < 0.001），initial trough concentration 較低（2.46 [1.85-3.04] mg/L vs. 4.13 [2.78-6.48] mg/L，P = 0.0003），voriconazole-related adverse events 較少（15.4% vs. 38.5%，P = 0.022）。臨床療效與後續 dose adjustment 兩組無顯著差異；CYP2C19 phenotype、肝功能、凝血指標與 daily dose 皆與 trough concentration 相關。
Limitation：主要限制是非隨機、依實際處方分組，即使用 propensity score matching 仍可能有 residual confounding 與 selection bias。配對後樣本僅 78 位，臨床療效並非主要能被充分檢驗的硬 outcome，且 target trough attainment 是 pharmacokinetic surrogate，仍需多中心前瞻性驗證。
Bottom line：VALID regimen 可作為肝功能異常病人 voriconazole 起始劑量的候選策略，但不能取代 TDM 與個別化調整。
GRADE 證據等級：Very low ⊕◯◯◯

Real-World Effectiveness and Renal Safety of Foscarnet for CMV Reactivation After Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation¶

J Clin Med | DOI | PMID 42652768

設計：這是單中心、回溯性真實世界 cohort，納入 2022 年 5 月至 2025 年 2 月接受 foscarnet 治療 CMV reactivation 的成人 allo-HCT 病人。研究重點同時放在 virological effectiveness 與 renal safety，並探索 foscarnet 治療期間 AKI 的相關因子。
樣本：研究共 40 名成人 allo-HCT recipients，皆因 CMV reactivation 接受 foscarnet；摘要未提比較組或追蹤時間。這個族群臨床上很核心，因為 ganciclovir／valganciclovir 的骨髓抑制與 letermovir 可近性，常使 foscarnet 成為不得不用的替代選項。
關鍵數字：CMV PCR negativity 達成率為 90%，達陰性的中位時間為 10 天（range 4–28 天），顯示短期病毒學反應不差；但 AKI 發生率高達 42.5%，12.5% 需要 hemodialysis。foscarnet 治療後 serum creatinine 上升，potassium、calcium、magnesium 下降（皆 p < 0.05）；univariable logistic regression 中 myeloablative conditioning 與 AKI 較高 odds 相關（OR 10.29，95% CI 1.15–91.63），男性則只有趨勢（OR 4.28，95% CI 0.96–19.01）。
Limitation：主要限制是回溯性、單中心、樣本很小，且沒有 valganciclovir、ganciclovir、letermovir 或未用 foscarnet 的比較組，因此無法推論 foscarnet 相對療效或相對腎毒性。AKI 相關因子只做 univariable analysis，CI 很寬，confounding by indication、移植強度、併用 nephrotoxic agents、基礎腎功能與 CMV disease severity 都可能影響結果。
Bottom line：allo-HCT 後 CMV reactivation 若需用 foscarnet，病毒學清除可能很快，但 AKI 與電解質異常風險高，臨床上應把腎功能與電解質監測視為治療核心，而不是附帶安全性檢查。
GRADE 證據等級：Very low ⊕◯◯◯

🔴 Transplant & Opportunistic Infections¶

Integrated diagnostic strategies for Pneumocystis pneumonia: bronchoalveolar lavage qPCR cycle threshold and serum β-D-glucan¶

Authors: Marando M et al. | Journal: Clin Microbiol Infect | Date: 2026 Aug 26
DOI: 10.1016/j.cmi.2026.08.033 | PMID: 42648481

TL;DR: 774 次 BALF qPCR 中 47 例為 PCP；Ct cutoff 30 的 AUC 0.85，BDG cutoff 9 pg/mL 的 AUC 0.96，合併判讀可區分 infection 與 colonization。

嘻嘻：PCP 診斷終於不像通靈大賽了。

Molecular Profiling and Disease Tracking of Post-transplant Lymphoproliferative Disorders using Cell-free DNA¶

Authors: Zhong Y et al. | Journal: Blood Adv | Date: 2026 Aug 26
DOI: 10.1182/bloodadvances.2025018879 | PMID: 42647869

TL;DR: 27 名 PTLD 患者、86 份 plasma 樣本顯示 baseline ctDNA 偏高預示 rituximab monotherapy 成效差；interim ctDNA 陰性較 PET/CT 更能預測 EOT complete metabolic response。

嘻嘻：ctDNA 又往血液腫瘤水晶球靠近一步。

Candidalysin at the epithelial-systemic interface: mechanistic evidence, critical-care relevance, and translational opportunities in invasive candidiasis¶

Authors: Fu Y et al. | Journal: Front Cell Infect Microbiol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fcimb.2026.1918325 | PMID: 42657083

TL;DR: Candidalysin 已確認可造成 epithelial damage 與 mucosal immune activation，但對 invasive candidiasis 的人體證據有限；較適合作為 toxin-producing Candida albicans infection 的 biomarker 或 adjunctive target。

嘻嘻：Candida 的毒素劇本越來越有戲。

A case series study of fever-diarrhea-hematochezia triad as the first presentation in plasma EBV DNA-positive diseases¶

Authors: Zhang H et al. | Journal: Front Cell Infect Microbiol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fcimb.2026.1916422 | PMID: 42656448

TL;DR: 14 例 EBV-FDH 平均 46.5 歲、男性 71.4%，誤診率 57.1%、死亡率 64.3%；部分患者經 HSCT、chemotherapy 或手術後可長期存活。

不嘻嘻：EBV 這種開場白，真的很不講武德。

Bidirectional Temporal Association Between Cytomegalovirus Reactivation and Graft-Versus-Host Disease Following Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation: A Single-Center Real-World Cohort Study¶

Authors: İşleyen E et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Aug 11
DOI: 10.3390/v18080874 | PMID: 42655692

TL;DR: 100 名 allo-HSCT 成人中 CMV reactivation 72%、GVHD 51%；time-dependent Cox 顯示 CMV 後續增加 GVHD 風險（HR 2.93），GVHD 也增加 CMV 風險（HR 1.98）。

不嘻嘻：CMV 和 GVHD 根本互相遞刀。

HIV-Tuberculosis Co-Infection Among Immigrants and Refugees in the United States: An Integrative Review¶

Authors: Abutu PO et al. | Journal: Int J Environ Res Public Health | Date: 2026 Jul 29
DOI: 10.3390/ijerph23080987 | PMID: 42652303

TL;DR: 整合 2015–2025 年 16 篇美國移民與難民資料，HIV-TB care 受 stigma、保險不足、遣返恐懼、創傷與醫療不信任影響，需 trauma-informed、community-engaged 介入。

不嘻嘻：藥有了，人卻還卡在制度門口。

Hearing-Functioning Problems Across High-Burden Adult Health Conditions in Africa¶

Authors: Dawood G et al. | Journal: Int J Environ Res Public Health | Date: 2026 Jul 28
DOI: 10.3390/ijerph23080974 | PMID: 42652290

TL;DR: 非洲 2007–2022 年 97 篇研究顯示，HIV/AIDS、TB、DM 等常伴 hearing loss、tinnitus 與 vestibular dysfunction；TB 偏 auditory，HIV/AIDS 與 DM 較多 auditory-vestibular involvement。

不嘻嘻：感染治好了，耳朵還在收尾款。

Identification of Invasive Aspergillosis in Electronic Health Records¶

Authors: Rayens E et al. | Journal: Open Forum Infect Dis | Date: 2026 Aug
DOI: 10.1093/ofid/ofag478 | PMID: 42656534

TL;DR: Kaiser Permanente 南加州 EHR 以 7 種 IA 定義辨識 86–4580 例；多數結構化定義與 EORTC/MSG 結果相近，最大 cohort 1067 例，6 個月死亡率 11.7%–33.1%。

嘻嘻：EHR 終於有機會幫 IA 抓人了。

Immunological Determinants of Oncogenic Virus-Driven Cancers in Africa: Mechanisms, Co-Infections and Public Health Challenges¶

Authors: Aliyu VA et al. | Journal: Pathogens | Date: 2026 Jul 28
DOI: 10.3390/pathogens15080800 | PMID: 42654738

TL;DR: 非洲 virus-driven cancers 受 HIV、malaria、helminths、TB、HLA diversity 與免疫逃脫交互影響；oncogenic viruses 約占全球 cancer 20%，但負擔集中於撒哈拉以南非洲。

不嘻嘻：病毒、共病、貧窮一起組團打副本。

Antithymocyte Globulin Induction Dosed on Ideal Body Weight: Absolute Lymphocyte Count (ALC) Depletion in Kidney Transplant Recipients with and without Obesity¶

Authors: Ramos R et al. | Journal: Clin Transplant | Date: 2026 Sep
DOI: 10.1111/ctr.70663 | PMID: 42656140

TL;DR: 126 名 kidney transplant recipient 比較 IBW-based ATG dosing，肥胖與非肥胖者 POD1–4 ALC depletion 相近；肥胖組 ABW 換算劑量較低、CMV viremia 較高，但 rejection 與存活相近。

嘻嘻：ATG dosing 看來不用被體重嚇壞。

HIV/AIDS in the state of Amazonas, Brazilian Amazon: decentralization, third-party support and community action¶

Authors: Benzaken AS et al. | Journal: Rev Soc Bras Med Trop | Date: 2026
DOI: 10.1590/0037-8682-0048-2026 | PMID: 42659512

TL;DR: 巴西亞馬遜州 62 市、約 430 萬人口，HIV/AIDS care 由瑪瑙斯逐步 decentralization；近十年 ART、PrEP、PEP、自我篩檢與第三方合作伴隨 AIDS mortality 下降。

嘻嘻：把照護帶出去，真的會改變結局。

Barriers to latent tuberculosis screening and treatment among people living with HIV in Brazil¶

Authors: Mattera EG et al. | Journal: Rev Bras Enferm | Date: 2026
DOI: 10.1590/0034-7167-2025-0416 | PMID: 42659504

TL;DR: 巴西 5 城 25 名專業人員指出，PLHIV 的 latent Mycobacterium tuberculosis infection screening 與 preventive treatment 受處方抗拒、訓練落差、資源不足與區域不平等阻礙。

不嘻嘻：LTBI 老問題，卡關點還是很人間。

Outcomes of ABO-Incompatible Versus ABO-Compatible Liver Transplantation in Pediatric Recipients: An Updated Systematic Review and Meta-Analysis¶

Authors: Panda K et al. | Journal: Pediatr Transplant | Date: 2026 Sep
DOI: 10.1111/petr.70430 | PMID: 42657913

TL;DR: 17 篇 pediatric LT meta-analysis 顯示 ABO-i 與 ABO-c 的 1、3、5 年 patient/graft survival 與 CMV、EBV、PTLD 差異不顯著；ABO-i 的 AMR 較高（RR 20.04）。

嘻嘻：ABO-i 兒肝移植沒有想像中可怕。

Latent tuberculosis infection shapes gut microbiome and immune-metabolic interactions in people living with HIV¶

Authors: Devadiga P et al. | Journal: Gut Microbes | Date: 2026 Dec 31
DOI: 10.1080/19490976.2026.2721739 | PMID: 42657534

TL;DR: ART-naive PLHIV 中，LTBI 使 gut microbiome 呈低 Firmicutes/Bacteroidota、butyrate-producing Firmicutes 減少，且與 PD-1+CD8+ T cells、IP-10、SCFA 與 CD4/CD8 ratio 相關。

嘻嘻：腸道菌又默默加入 HIV-TB 群聊。

Asian consensus on diagnostic algorithm for invasive pulmonary fungal diseases in high-burden settings¶

Authors: Fang W et al. | Journal: J Transl Int Med | Date: 2026 Aug
DOI: 10.1515/jtim-2026-0065 | PMID: 42657100

TL;DR: 18 國專家提出亞洲 high-burden settings 的 IPFD diagnostic algorithm，因應 DM、TB、HIV 共病、pathogen 異質性與診斷資源落差；內容限診斷流程，不含 antifungal therapy 建議。

嘻嘻：亞洲版 IPFD 路線圖終於比較接地氣。

The Epidemiology of Pulmonary Hypertension in Sub-Saharan Africa-A Systematic Report¶

Authors: Zeder K et al. | Journal: Pulm Circ | Date: 2026 Jul
DOI: 10.1002/pul2.70388 | PMID: 42656914

TL;DR: 105 篇、23,384 人的系統回顧估算，2021 年撒哈拉以南非洲 likely PH 盛行率達 1.2%、at risk PH 達 1.9%，RHD 貢獻 31% 居首。

不嘻嘻：PH 在資源少的地方更難纏，臨床只能先苦笑。

VALID regimen of voriconazole optimizes therapeutic target attainment and minimizes adverse events in patients with liver dysfunction¶

Authors: Li J et al. | Journal: Front Pharmacol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fphar.2026.1895947 | PMID: 42656781

TL;DR: 肝功能異常患者中，VALID voriconazole 起始劑量使 target trough attainment 提升至 89.7%（對照 48.7%），不良事件降至 15.4%（對照 38.5%）。

嘻嘻：voriconazole 終於比較像精準用藥，不是抽籤。

The Janus Face of Aspergillus in Fish Aquaculture: From Pathogenic Threat to Functional Feed Additive¶

Authors: Haroun M et al. | Journal: Vet Sci | Date: 2026 Jul 24
DOI: 10.3390/vetsci13080737 | PMID: 42655757

TL;DR: 超過 90 篇文獻顯示 Aspergillus 在魚類養殖具雙重角色：A. flavus、A. fumigatus 可致 aspergillosis 與 aflatoxin 污染，非毒性菌株則可作 probiotics 與 feed additive。

不嘻嘻：Aspergillus 連魚塭都能搞雙面人生，太會。

Fungal Infections Associated with Sphingosine 1-Phosphate Receptor Modulators: Immunological Mechanisms, Clinical Patterns, and Management Considerations¶

Authors: Yazdan KM et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Aug 21
DOI: 10.3390/microorganisms14081861 | PMID: 42655205

TL;DR: S1P receptor modulators 相關 IFI 文獻含 43 例與 60 人 case series，cryptococcosis 最常見，多數發生於 fingolimod；目前不建議常規 cryptococcal antigen 篩檢或 primary prophylaxis。

不嘻嘻：免疫調節藥的帳單，最後常由黴菌來收。

ROP64-Deficient Toxoplasma gondii Strain Confers Protection Against Acute and Chronic Toxoplasmosis in Mice¶

Authors: Zheng Z et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Aug 06
DOI: 10.3390/microorganisms14081725 | PMID: 42655070

TL;DR: CRISPR-Cas9 產生的 T. gondii RHΔrop64 在 Kunming mice 毒力明顯降低；接種後對 RHΔku80、ToxoDB#9 急性感染有 substantial protection，口服 10 或 40 Pru cysts 後全數存活。

嘻嘻：T. gondii 疫苗線索又亮一點，老鼠先鼓掌。

Antifungal Susceptibility and Cyp51A Gene Variation Analysis of Aspergillus fumigatus Isolated from Soils in Tea-Growing Areas of Guizhou, China¶

Authors: Zhou D et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Aug 04
DOI: 10.3390/microorganisms14081704 | PMID: 42655049

TL;DR: 中國貴州 9 處茶園分離 191 株 A. fumigatus，itraconazole MIC 0.015–0.5 μg/mL、voriconazole 0.031–0.25 μg/mL，未見 triazole resistance。

嘻嘻：茶園土裡暫時沒看到 triazole 噩夢，先喝口茶。

Synergic Effect of Fluconazole and Quinoline Derivatives Combination Against Cryptococcus spp., Mechanisms of Action and Toxicity¶

Authors: Genz Bazana LC et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Jul 29
DOI: 10.3390/microorganisms14081654 | PMID: 42655000

TL;DR: fluconazole 合併 clioquinol 或 8-hydroxyquinoline 對 Cryptococcus neoformans 與 C. gattii 在 0.125–0.25 µg/mL 即有強 synergistic effect，且未見顯著刺激性或毒性。

嘻嘻：fluconazole 找到好隊友，老藥也能再上場。

On the Verge of the 3000th Publication: Reflections on Deceptions, Successes and Perspectives¶

Authors: De Clercq E | Journal: Molecules | Date: 2026 Aug 20
DOI: 10.3390/molecules31162896 | PMID: 42653977

TL;DR: 近 3,000 篇 antiviral 研究累積約 10 個上市藥物，涵蓋 HSV、VZV、CMV、HIV、HBV；另提出 filo-、rhabdo-、arena- 等病毒未來開發策略。

嘻嘻：antiviral 這條路很長，但真的走出過黃金。

Study Clinical Characteristics and Outcomes of Candida auris Candidemia in Adult Intensive Care Unit Patients: A 30-Month Retrospective Study¶

Authors: Unsel M et al. | Journal: J Clin Med | Date: 2026 Aug 18
DOI: 10.3390/jcm15166389 | PMID: 42652794

TL;DR: 新開院 30 個月內 3,716 名 ICU 成人中 432 例 candidemia，22 例（5.1%）為 C. auris；整體 ICU 死亡率 77.3%，non-survivors APACHE II 較高。

不嘻嘻：C. auris 進 ICU 後，大家的血壓都先上來。

Real-World Effectiveness and Renal Safety of Foscarnet for CMV Reactivation After Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation¶

Authors: Kaynar L et al. | Journal: J Clin Med | Date: 2026 Aug 18
DOI: 10.3390/jcm15166365 | PMID: 42652768

TL;DR: 40 名 allo-HCT 後 CMV reactivation 接受 foscarnet 者，90% 達 PCR 陰性，中位 10 天；AKI 發生率 42.5%，12.5% 需 hemodialysis。

不嘻嘻：foscarnet 很能打，但腎臟也常被波及。

A Live Attenuated AP2X-1-Deficient Toxoplasma Strain Confers Protective Immunity Against Acute and Chronic Toxoplasmosis in a Murine Model¶

Authors: Hao WB et al. | Journal: Animals (Basel) | Date: 2026 Aug 07
DOI: 10.3390/ani16162453 | PMID: 42651858

TL;DR: PruΔap2X-1 最高 5 × 10^6 tachyzoites 感染小鼠仍 100% 存活且無腦 cysts；接種後對 Pru 與 ToxoDB#9 急性 challenge 皆 100% 存活。

嘻嘻：toxoplasmosis 疫苗候選又推進，至少小鼠很買單。

Pregnancy Outcomes After Belatacept Exposure in Solid Organ Transplant Recipients: A Scoping Review¶

Authors: Tawhari I et al. | Journal: Healthcare (Basel) | Date: 2026 Aug 16
DOI: 10.3390/healthcare14162561 | PMID: 42651330

TL;DR: belatacept 妊娠暴露僅 3 篇、15 名移植受者 21 次妊娠；16 次活產、5 次流產，活產兒未見 congenital malformations，但證據確定性極低。

不嘻嘻：belatacept 懷孕資料少到臨床只能小心翼翼。

Risk Factors for Mortality Among Patients with Bloodstream Infection Caused by Candidozyma auris in Colombia¶

Authors: Pimiento-Díaz M et al. | Journal: Antibiotics (Basel) | Date: 2026 Aug 07
DOI: 10.3390/antibiotics15080758 | PMID: 42650683

TL;DR: 哥倫比亞 7 院 134 例 C. auris BSI，30 天死亡率 38.1%；年齡、corticosteroid、48 小時內 shock 增加死亡，較高 EQUAL Candida Score 則降低死亡。

不嘻嘻：C. auris BSI 仍是硬仗，早期處置不能慢。

Infectious Diseases and Pulmonary Arterial Hypertension: A Review¶

Authors: da Luz Goulart C et al. | Journal: Heart Lung Circ | Date: 2026 Aug 26
DOI: 10.1016/j.hlc.2026.06.015 | PMID: 42648991

TL;DR: 感染相關 PAH 證據以 HIV 與 schistosomiasis 最強，HCV/HBV 次之，COVID-19 較弱；共同機轉包含 chronic inflammation、endothelial dysfunction 與 vascular remodelling。

不嘻嘻：感染後的血管後遺症，總是比想像更黏。

Urinary HSP90 as a Non-invasive Biomarker of Active Tubular Injury in Kidney Transplant Recipients: A Multicenter Prospective Study¶

Authors: Tachikawa K et al. | Journal: Cell Stress Chaperones | Date: 2026 Aug 26
DOI: 10.1016/j.cstres.2026.100209 | PMID: 42648627

TL;DR: 112 名 kidney transplant recipients、262 組尿液與血清配對顯示，detectable uHSP90 獨立關聯 active tubular injury（OR 4.93，95% CI 2.21–11.00）。

嘻嘻：尿液 biomarker 若可靠，腎臟少挨幾針最好。

🟢 One Health / Zoonoses¶

Surveillance for Asiatic filoviruses and zoonotic paramyxoviruses at a perceived wildlife-human interface¶

Authors: Sterling SL et al. | Journal: Emerg Microbes Infect | Date: 2026 Dec
DOI: 10.1080/22221751.2026.2713324 | PMID: 42659624

TL;DR: 泰國中部洞穴採樣234人與272隻蝙蝠，首次在泰國蝙蝠見Asiatic filoviruses血清證據；採礦相關工作者parahenipaviruses血清陽性較高（Gamak virus OR 3.41）。

不嘻嘻：洞穴工作現場，蝙蝠又遞來一張病毒名片。

Genetic Diversity, Reassortment Patterns, and Antigenic Characterization of Two H9N2 Avian Influenza Viruses Isolated from Quails in China¶

Authors: Teng Y et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Aug 21
DOI: 10.3390/v18080919 | PMID: 42655736

TL;DR: 中國河北2024–2025年鵪鶉分離2株H9N2，ZHY0417A11帶多基因reassortment，M基因與人類H3N8相似99.32%；兩株皆與疫苗株SS明顯antigenic drift（R < 0.5）。

不嘻嘻：H9N2又在換裝，疫苗追劇進度明顯落後。

Simulating the Transmission of Rift Valley Fever Virus via Raw Milk Consumption in Inter-Epidemic Periods¶

Authors: Buyukcangaz E et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Aug 13
DOI: 10.3390/v18080889 | PMID: 42655706

TL;DR: 肯亞基蘇木1000個農場agent-based simulation顯示，inter-epidemic期間經生乳感染RVFV累積發生率可達0.4–13%；若生乳致感染機率40%，升至3.7–28%。

不嘻嘻：生乳信仰遇上RVFV，腸胃先不說，公衛很累。

Bacteriophages Against Aeromonas Species in Aquaculture: An Integrative Review of Therapeutic Applications, Genomic Advances and Future Directions¶

Authors: Çağatay İT | Journal: Viruses | Date: 2026 Aug 09
DOI: 10.3390/v18080868 | PMID: 42655686

TL;DR: 1981–2026年水產養殖文獻整合顯示，針對Aeromonas spp.的phage cocktails較單一phage抗菌範圍更廣且較少抗藥性；預防性使用提升存活率優於感染後治療。

嘻嘻：phage cocktails看起來像水產版精準補位。

Current Strategies for Selecting Recombinant Orthopoxvirus Proteins for Immunobiological and Diagnostic Applications¶

Authors: Zhakypbek A et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Aug 07
DOI: 10.3390/v18080863 | PMID: 42655681

TL;DR: Orthopoxvirus recombinant antigens中，IMV相關蛋白主要參與neutralization，EV相關抗原較影響病毒散播；合併IMV與EV抗原最有潛力用於serology與次世代subunit vaccines。

嘻嘻：Orthopoxvirus抗原拼圖終於比較像地圖了。

Pan-Viral Sequencing Surveillance Identifies Mammalian Orthoreovirus 2 in United States Wastewater¶

Authors: Collins JP et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Aug 06
DOI: 10.3390/v18080862 | PMID: 42655680

TL;DR: 2024年3月美國空軍官校廢水以VirCapSeq-VERT偵測到MRV-2並取得10段完整genome；序列最接近賓州蝙蝠株，訊號兩週內幾乎消失。

嘻嘻：廢水監測又立功，連短暫訊號都抓得到。

Bat-Associated Parvoviruses: High Genetic Diversity and Novel Viruses in Gia Lai and Dong Nai Provinces, Vietnam¶

Authors: Lapshina VK et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Aug 06
DOI: 10.3390/v18080860 | PMID: 42655678

TL;DR: 越南嘉萊與同奈150份、26種蝙蝠樣本中，parvoviruses陽性38份（25%），鑑定45個OTUs；95%變異株可能為新種或更高階新lineages。

不嘻嘻：蝙蝠病毒多樣性，永遠比我們命名速度快。

Sustaining Mpox Surveillance, Research, and Care Integration in a Post-PHEIC, Resource-Constrained World¶

Authors: Katoto PDMC et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Aug 01
DOI: 10.3390/v18080844 | PMID: 42655662

TL;DR: 2024年mpox PHECS/PHEIC雖已於2025年9月與2026年1月解除，剛果民主共和國東部及鄰國clade Ib傳播仍持續，孕婦與兒童重症風險未消失。

不嘻嘻：mpox警報解除，不代表弱勢族群能下班。

Long-Term Epidemiological Trends and Risk Factors of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever in Kazakhstan: An Integrated Epidemiological and Entomological Analysis¶

Authors: Abuova GN et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Jul 31
DOI: 10.3390/v18080840 | PMID: 42655658

TL;DR: 哈薩克1980–2023年CCHF監測顯示每4–6年流行高峰、6–7月最高；南部endemic區年發生率為全國2.67倍，2011–2023年有50,671次tick bite就醫。

不嘻嘻：CCHF季節表很準，tick也準時上工。

Seroprevalence and Risk Factors Associated with Anti-Toxocara spp. IgG Seropositivity Among Cat Owners in an Island Community: A Cross-Sectional Study in Koh Yao District, Phang Nga Province, Thailand¶

Authors: Na-Ek P et al. | Journal: Int J Environ Res Public Health | Date: 2026 Jul 31
DOI: 10.3390/ijerph23081007 | PMID: 42652322

TL;DR: 泰國攀牙府閣堯島291名貓飼主中，anti-Toxocara spp. IgG陽性率34.36%；接觸貓後未洗手與陽性相關（OR 1.96，95% CI 1.16–3.33）。

不嘻嘻：愛貓可以，摸完不洗手就很寄生蟲友善。

Prevalence and Antimicrobial Resistance Profiles of Salmonella and Escherichia coli, and Hygiene Practices in Retail Poultry Meat Shops of Bharatpur, Nepal¶

Authors: Thapa S et al. | Journal: J Food Prot | Date: 2026 Aug 26
DOI: 10.1016/j.jfp.2026.100906 | PMID: 42648406

TL;DR: 尼泊爾巴拉特普爾140家零售禽肉店雞肝中，E. coli盛行率24.3%、Salmonella 16.4%；Ampicillin抗藥性均>79%，MDR分別達94.1%與73.9%。

不嘻嘻：禽肉攤的AMR成績單，難看得很穩定。

The Role of Migratory Birds in the Dissemination of Antimicrobial Resistance: A One Health Perspective¶

Authors: Ali A et al. | Journal: Vet Sci | Date: 2026 Aug 04
DOI: 10.3390/vetsci13080782 | PMID: 42655802

TL;DR: 候鳥常可攜帶MDR E. coli、Klebsiella pneumoniae、Salmonella spp.等與blaCTX-M、mcr、tet等ARGs；現有證據較支持其作為AMR sentinel與opportunistic carriers。

不嘻嘻：候鳥沒有惡意，只是順便帶著ARG環遊世界。

Salmonella Infection Induces Orchitis and Disrupts the Blood-Testis Barrier, Leading to Spermatogenic Disorders in Mice¶

Authors: Li Y et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Aug 21
DOI: 10.3390/microorganisms14081862 | PMID: 42655206

TL;DR: 30隻雄性Kunming小鼠陰囊內注射S. Enteritidis H71或S. Agona W42後出現orchitis、精子減少與BTB破壞；4546個共同差異表現基因富集TLR、NF-κB、MAPK pathways。

不嘻嘻：Salmonella這一招，男性生殖科也開始頭痛。

Prevalence and Characteristics of Salmonella from a Laying Hen Production Chain in Jiangsu Province, China¶

Authors: Xia A et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Aug 11
DOI: 10.3390/microorganisms14081767 | PMID: 42655112

TL;DR: 中國江蘇蛋雞產業鏈979件樣本分離84株Salmonella（8.58%），以S. Enteritidis 41.7%最多；30株受測對NAL與CIP皆100%抗藥，cgSNP支持跨階段傳播。

不嘻嘻：蛋雞鏈上的S. Enteritidis，跑得比稽核快。

Genomic Insights into the Population Structure and Antimicrobial Resistance of the Most Prevalent Human-Associated Non-Typhoidal Salmonella Serotypes in Romania¶

Authors: Oprea M et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Aug 05
DOI: 10.3390/microorganisms14081716 | PMID: 42655061

TL;DR: 羅馬尼亞2023–2025年271株人類非傷寒Salmonella中，148株帶至少1個AMR determinant，4%預測為MDR；主要lineages為S. Enteritidis ST11、S. Typhimurium ST19與monophasic ST34。

不嘻嘻：非傷寒Salmonella還沒失控，但已經會擺陣。

🟡 Food Security / Food Safety¶

Genotoxicity, subchronic toxicity, and allergenicity evaluation of IgG Binding Protein CBB produced from Komagataella phaffii¶

Authors: Lozon D et al. | Journal: Food Chem Toxicol | Date: 2026 Aug 26
DOI: 10.1016/j.fct.2026.116346 | PMID: 42648623

TL;DR: Komagataella phaffii 製 IgG Binding Protein CBB 無 genotoxicity；rat 13 週灌食未見相關毒性，NOAEL 為 614 mg/kg/day，in silico 顯示 allergenicity 與 cross-reactivity 風險低。

嘻嘻：生技原料先把安全性補齊，總算有點大人樣。

Subzero Control of Human Norovirus and Indicator Microorganisms on Frozen Foods Using an Antifreeze-Peracetic Acid Formulation¶

Authors: Jiao Y et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Aug 01
DOI: 10.3390/v18080846 | PMID: 42655664

TL;DR: Af-PAA 在 -40 °C 處理 60 分鐘，可使冷凍藍莓、胡蘿蔔、雞胸與北極蝦上的 HuNoV GII.4[P31] RNase-resistant RNA 訊號下降 3.0–3.1 log10，且未見外觀改變。

嘻嘻：冷凍食品也能處理，norovirus 終於被凍到不好笑。

Plant Viral Metagenomic Analysis from a Preliminary Field Survey in Angola Reveals Complex Mixed Infections in Vegetable Crops¶

Authors: Amoia SS et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Jul 26
DOI: 10.3390/v18080822 | PMID: 42655644

TL;DR: 2024 年安哥拉兩省少量蔬菜與野草樣本的 high-throughput sequencing 顯示 polero-, begomo-, tobamoviruses 混合感染，另在野草發現未知 carlavirus，提示需擴大監測與使用 virus-free seeds。

不嘻嘻：蔬菜病毒開同樂會，田間監測又多一題申論。

Dietary Risk of Neonicotinoids and Other Pesticides in Mexican Children Residing in Agroindustrial Zones¶

Authors: García Villegas IA et al. | Journal: Int J Environ Res Public Health | Date: 2026 Aug 01
DOI: 10.3390/ijerph23081009 | PMID: 42652324

TL;DR: 墨西哥 Jalisco 農工區 23 戶 4–5 歲兒童常吃食物中，31 件樣本有 87% 檢出 pesticide residues、共 34 種化合物；7 件超過 EU、美國或墨西哥 MRLs，生食貢獻 96% 暴露量。

不嘻嘻：小孩吃蔬果也要抽盲盒，這世界真會出題。

Healthy Eating and Food Hygiene Among Adolescents in Central Kazakhstan: A Cross-Sectional Study¶

Authors: Kuandyk U et al. | Journal: Int J Environ Res Public Health | Date: 2026 Jul 30
DOI: 10.3390/ijerph23080997 | PMID: 42652315

TL;DR: 哈薩克中部 Karaganda 六校 382 名 11–18 歲學生中，女生較常具備 healthy eating 與 food hygiene 知識；家長回報 61.5% 每日吃水果，男、女每日 fast food 分別 7.7% 與 7.5%。

嘻嘻：青少年還願意學 food hygiene，已經值得鼓掌。

Occurrence and Co-Occurrence of Regulated and Emerging Mycotoxins in Foods Marketed to U.S. Toddlers¶

Authors: Gonya S et al. | Journal: Int J Environ Res Public Health | Date: 2026 Jul 23
DOI: 10.3390/ijerph23080949 | PMID: 42652266

TL;DR: 美國市售 118 件 toddler foods 以 LC-MS/MS 檢測 34 種 mycotoxins，32 種被檢出、25 種可定量；87% 產品至少含 1 種，平均每件 3.7 種、最多 13 種，且多項超過 FDA 或 TDI 限值。

不嘻嘻：toddler foods 也能集滿 mycotoxins，育兒真的硬核。

Drivers of the paradigm shift in norovirus diagnostics: technological innovation, contextual demands, and collaborative synergy¶

Authors: Peng Z et al. | Journal: Virol J | Date: 2026 Aug 26
DOI: 10.1186/s12985-026-03278-z | PMID: 42649517

TL;DR: norovirus diagnostics 已由 electron microscopy 與 immunoassays 轉向 RT-qPCR；isothermal amplification、CRISPR、dPCR 與 microfluidic POCT 可提升速度與情境適配，但 standardization、QC 與污染防治仍是瓶頸。

嘻嘻：norovirus POCT 越來越近，急診會想先預購。

Insights into the Genetic Diversity of Yersinia enterocolitica Isolated from Poultry and Red Meat in South Korea in 2024¶

Authors: Kim D et al. | Journal: Pathogens | Date: 2026 Aug 04
DOI: 10.3390/pathogens15080821 | PMID: 42654758

TL;DR: 韓國 2024 年雞、豬、牛、鴨肉分離 91 株 Y. enterocolitica，WGS 皆預測為 biotype 1A/sub-biotype 1Aa，含 27 STs、43 core-genome types；pYV 缺失但保留 yapE、inv、ystB 等 chromosomal virulence genes。

不嘻嘻：肉品裡的 Yersinia 很會藏招，別被 1A 騙了。

Analytical Validation and Preliminary Diagnostic Performance Evaluation of GenoPATHX™ Multiplex qPCR for Quantitative Detection of Key Salmonella Serovars in Poultry Matrices¶

Authors: Nyarku R et al. | Journal: Pathogens | Date: 2026 Jul 25
DOI: 10.3390/pathogens15080791 | PMID: 42654729

TL;DR: GenoPATHX™ multiplex qPCR 偵測家禽相關 priority Salmonella serovars，R2 0.987–0.999、LoD95 60–545 genome equivalents/reaction；田野樣本 sensitivity 81.0%、specificity 91.3%，與 USDA-FSIS culture κ=0.73。

嘻嘻：家禽 Salmonella 快篩變實用，廚房防線加分。

Development and implementation of a community-oriented approach to food safety management in a Rural Thai community¶

Authors: Keawdounglek V et al. | Journal: PLoS One | Date: 2026
DOI: 10.1371/journal.pone.0350910 | PMID: 42658876

TL;DR: 泰國清萊 Wiang Kaen 204 戶與 8 處食品場所的 COAFM early implementation 顯示 contamination 普遍低，但外部市場大蒜有 pesticide residues；性別、年齡與稻作生產與家庭 food safety knowledge 相關。

嘻嘻：社區自己管食品安全，這種接地氣介入很可以。

Transcriptomic Analysis of Salmonella Typhimurium After Exposure to Blue Light¶

Authors: Hur M et al. | Journal: J Food Prot | Date: 2026 Aug 26
DOI: 10.1016/j.jfp.2026.100907 | PMID: 42648404

TL;DR: Salmonella Typhimurium 14028s 經 405 nm aBL 252 J/cm2 亞致死暴露後，RNA-seq 顯示 24 個 DEGs，katG 上升 log2FC 4.5；katG、ulaB/E/G/R mutants 對 aBL 較敏感（P<0.05）。

嘻嘻：藍光逼出 Salmonella 壓力反應，弱點露出來了。

Foodborne Pathogen Surveillance and Economic Return on Investment Estimates for U.S. GenomeTrakr laboratories¶

Authors: Allard MW et al. | Journal: J Food Prot | Date: 2026 Aug 26
DOI: 10.1016/j.jfp.2026.100901 | PMID: 42648403

TL;DR: 美國 GenomeTrakr 國內實驗室的 WGS 食媒 pathogen surveillance 皆呈正 ROI，averted healthcare costs 超過建立 genomics capacity 成本；新 web app 可估算 Salmonella、Listeria 與 STEC 的 benefit-to-cost ratios。

嘻嘻：WGS 監測不只酷，還能跟會計部交代。

Assessment of Pathogen Contamination in Food at Teaching Hospitals in Mashhad, Iran: A Cross-Sectional Study¶

Authors: Raeisi M et al. | Journal: Health Sci Rep | Date: 2026 Sep
DOI: 10.1002/hsr2.72962 | PMID: 42657327

TL;DR: 伊朗 Mashhad 12 家教學醫院 360 件餐食中，16.4% 未達 microbial quality standards；檢出 Salmonella spp. 8.3%、Listeria monocytogenes 5.8%、E. coli O157:H7 1.1%，生菜污染最高。

不嘻嘻：醫院餐食也踩雷，院感人員真的沒有下班。

Similar Virulence Gene Repertoires but Distinct Stress Tolerance and Pathogenicity-Associated Phenotypes in Representative Salmonella Typhimurium ST19 and ST213 Strains from Mexico¶

Authors: Esquivel-Barriga FA et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Aug 20
DOI: 10.3390/microorganisms14081854 | PMID: 42655198

TL;DR: 墨西哥 Salmonella Typhimurium ST19 與 ST213 共有多數 virulence-associated genes（119 genes、26 VTs），但 ST213 代表株在 simulated GIT stress 與 C. elegans colonization 表現較強，顯示 phenotype 不能只靠 virulotype 預測。

不嘻嘻：virulotype 看似乖巧，phenotype 才是本尊。

Whole-Genomic and Functional Characterization of Lactiplantibacillus plantarum CLPX21 as Potent Probiotic Candidate¶

Authors: Xu S et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Aug 14
DOI: 10.3390/microorganisms14081789 | PMID: 42655133

TL;DR: Lactiplantibacillus plantarum CLPX21 具 probiotic 潛力：24 小時 auto-aggregation 47.15%、與 pathogens co-aggregation >67%、IPEC-J2 adhesion 6.37%，可抑制 E. coli biofilm 與 E. coli-induced inflammatory cytokines，且無 hemolysis。

嘻嘻：probiotic 候選株表現不錯，腸道隊友再添一員。

資料來源：PubMed (articles retrieved 2026-08-28)