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Daily Journal Digest — 2026-08-30

過去 24 小時新增:Transplant ID × 13、One Health × 10、Food Security × 10,共 33 篇。

⭐ 今日亮點


🔬 深入評讀

Human Cytomegalovirus Genetic Diversity, Clinical Relevance, and Emerging Insights

Rev Med Virol | IF 6.9 | DOI | PMID 42664505

  • 設計:這是一篇敘述性綜述,整理近 40 年 HCMV genotyping 文獻,聚焦 glycoprotein B、glycoprotein N、UL144 等基因型多樣性。文章橫跨不同宿主族群與臨床情境,特別關注免疫低下者、移植受贈者、先天性感染與嚴重全身性感染。
  • 樣本:綜述涵蓋 HCMV genotype 與臨床表現、抗病毒抗藥性、疫苗開發相關的既有研究,但摘要未提供系統性檢索策略、納入研究數或各研究年代分布。重點不是單一 cohort 的效應估計,而是把不同基因型研究放回臨床與免疫學脈絡中解讀。
  • 關鍵論點:文章指出 HCMV 的 glycoprotein B、glycoprotein N、UL144 等多型,可能與宿主族群、臨床表現、graft rejection、全身性感染、抗病毒抗藥性與疫苗設計有關。它的價值在於提醒臨床端:CMV 不是單一均質病原,genetic diversity 可能影響診斷詮釋、抗藥性監測、drug development 與 vaccine target 選擇。
  • Limitation:主要限制是 genotyping 技術與研究方法高度異質,導致跨研究比較困難,也限制 genotype 與臨床 outcome 之間的因果推論。作為敘述性綜述,若未做系統性檢索與 RoB 評估,容易受文獻選擇與發表偏倚影響。
  • Bottom line:對 transplant ID 讀者而言,HCMV genetic diversity 值得被視為 CMV 管理、抗藥性與疫苗開發的核心框架,而不是單純病毒分類問題。

Invasive candidiasis in the Intensive Care unit: diagnostic stewardship, source control, and precision antifungal therapy

Expert Rev Anti Infect Ther | DOI | PMID 42667299

  • 設計:這是一篇 ICU 視角的 narrative review,根據 PubMed/MEDLINE、Embase、Cochrane Library 於 2005 年 1 月至 2026 年 5 月的英文文獻搜尋撰寫。主題涵蓋 invasive candidiasis 的 contemporary epidemiology、診斷 stewardship、source control、catheter management、empirical 與 targeted antifungal therapy、TDM、PK 挑戰、emerging agents 與 Candida auris
  • 樣本:文章對象是重症成人 invasive candidiasis 的診斷與治療決策,並非單一原始研究 cohort;摘要未提供納入文獻總數或正式系統性回顧流程。它特別處理 ICU 常見的 colonization、免疫狀態改變、複雜解剖感染源與 extracorporeal support 下 PK 不穩定等情境。
  • 關鍵論點:核心論點是 ICU invasive candidiasis 的主要難題不只是延遲給予 antifungal therapy,而是正確判斷 positive fungal culture 或 beta-D-glucan、molecular assays 是否代表真正侵襲性感染。文章主張應將快速診斷、宿主免疫輪廓、source control、catheter 策略與 precision antifungal dosing 整合成 phenotype-driven management,以減少不必要 antifungal 暴露並改善 stewardship。
  • Limitation:作為敘述性綜述,摘要未顯示 formal RoB 評估、pooled effect 或明確推薦強度,因此不能直接量化各策略對死亡率或治療失敗的影響。ICU candidiasis 本身診斷標準與感染歸因困難,也使不同研究間的族群與 outcome 異質性偏高。
  • Bottom line:ICU candidiasis 管理應從「看到 Candida 就治療」轉向結合臨床脈絡、解剖感染源、biomarker 與 PK 的診斷與治療 stewardship。

🔴 Transplant & Opportunistic Infections

Human Cytomegalovirus Genetic Diversity, Clinical Relevance, and Emerging Insights

Authors: AlQahtani HY et al. | Journal: Rev Med Virol | Date: 2026 Sep
DOI: 10.1002/rmv.70197 | PMID: 42664505

TL;DR: HCMV 近 40 年 genotyping 顯示 glycoprotein B、glycoprotein N、UL144 等多型與宿主族群、臨床表現、抗病毒抗藥性及疫苗開發相關,但技術異質性仍限制比較。

不嘻嘻:HCMV 變裝秀開了四十年,疫苗考題還在加頁。


Kinetics of anti-Aspergillus spp. IgG antibodies in COVID-19-associated pulmonary aspergillosis

Authors: Cordier C et al. | Journal: Med Mycol | Date: 2026 Aug 29
DOI: 10.1093/mmy/myag089 | PMID: 42667380

TL;DR: 898 名 ICU SARS-CoV-2 患者中 47 例符合 CAPA;43 例測 AspAb,僅 23.3% 陽性,70% 於診斷後平均 8.3 天 seroconversion,支持其作為輔助而非早期診斷工具。

不嘻嘻Aspergillus 抗體慢半拍,ICU 醫師只能先猜拳。


The role of 1-3-beta-D-glucan in predicting Pneumocystis jirovecii Pneumonia in Immunocompromised Children

Authors: Keldorfer M et al. | Journal: J Pediatric Infect Dis Soc | Date: 2026 Aug 29
DOI: 10.1093/jpids/piag085 | PMID: 42667642

TL;DR: 106 名非 HIV 免疫低下兒童中,serum 1,3-β-D-glucan 對 Pneumocystis jirovecii pneumonia 的陰性預測值約 99%,低盛行率下陽性預測值有限,較適合排除 PJP。

嘻嘻:BDG 拿來排除 PJP,至少能少一點半夜驚嚇。


Invasive candidiasis in the Intensive Care unit: diagnostic stewardship, source control, and precision antifungal therapy

Authors: Martin-Loeches I et al. | Journal: Expert Rev Anti Infect Ther | Date: 2026 Aug 29
DOI: 10.1080/14787210.2026.2726965 | PMID: 42667299

TL;DR: ICU invasive candidiasis 管理重點不只是及早 antifungal therapy,而是結合 culture、beta-D-glucan、molecular assays、source control 與 pharmacokinetics,判斷 colonization 或真正侵襲性感染。

嘻嘻:ICU Candida 終於不是看到就打,理智回來了。


Characteristics of Primary and acquired multidrug-resistant tuberculosis patients in West Java, Indonesia

Authors: Santoso P et al. | Journal: IJID Reg | Date: 2026 Sep
DOI: 10.1016/j.ijregi.2026.100960 | PMID: 42666390

TL;DR: 印尼西爪哇 337 名 MDR-TB 患者中,32% 為 primary MDR-TB;曾接觸 TB index case 者 primary MDR-TB odds 較高(POR 4.31,95% CI 2.65–7.01),凸顯 contact investigation 重要性。

不嘻嘻:MDR-TB 連初登場都這麼硬,公衛班表哭了。


Daily HIV pre-exposure prophylaxis enhances monocyte activation and reprogrammes immune cell metabolism

Authors: Jameson G et al. | Journal: Front Immunol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fimmu.2026.1910812 | PMID: 42666216

TL;DR: 每日 TDF/FTC PrEP 使用者(n=15,中位 533 天)較 PrEP-naïve 者(n=11)有較高 monocyte HLA-DR、CD14 與 bacterial challenge 後 IL-1β、TNF,並在 6–9 個月出現代謝 reprogramming 訊號。

不嘻嘻:PrEP 也會撩動免疫,人體真的很會加戲。


PPD skin test positivity and in-hospital mortality across age groups in non-HIV tuberculous meningitis: a retrospective cohort study

Authors: Zeng W et al. | Journal: Front Neurol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fneur.2026.1820517 | PMID: 42666175

TL;DR: 1,574 名非 HIV TBM 患者住院死亡率 11.9%;整體 PPD 陽性與死亡無明確關聯(OR 1.30,95% CI 0.74–2.19),但兒童訊號偏高(OR 7.20)且僅基於 22 例死亡。

不嘻嘻:PPD 在 TBM 預後上又交白卷,還附模糊答案。


Authors: Ide N et al. | Journal: In Vivo | Date: 2026
DOI: 10.21873/invivo.14441 | PMID: 42665419

TL;DR: 日本 JADER 中 79 件 avacopan 相關死亡通報,感染事件 46 件、hepatobiliary disorders 21 件;vanishing bile duct syndrome 13 件,PJP 與 pneumonia 各 9 件,肝膽事件 94.1% 發生於 90 天內。

不嘻嘻:avacopan 的感染與肝膽警訊,藥單旁請放警鈴。


The role of corticosteroids in management of non-HIV immunocompromised patients hospitalized for Pneumocystis jirovecii pneumonia

Authors: Bialkowski C et al. | Journal: Infect Dis Now | Date: 2026 Aug 28
DOI: 10.1016/j.idnow.2026.105348 | PMID: 42665191

TL;DR: 101 名非 HIV 免疫低下 pneumocystosis 住院患者中,adjunctive corticosteroids 未降低 30 天死亡率(26% vs 18%),90 天與 1 年亦無效益;年輕及一般病房照護與較佳存活相關。

不嘻嘻:PJP 加 steroid 沒救場,老招式又被現實退貨。


Serious infections in patients with inflammatory bowel disease and corticosteroids: A propensity score-matched study

Authors: Forss A et al. | Journal: Clin Gastroenterol Hepatol | Date: 2026 Aug 28
DOI: 10.1016/j.cgh.2026.08.019 | PMID: 42665112

TL;DR: 瑞典全國 IBD 登錄 2007–2024 年資料顯示,所有治療類別合併 corticosteroids 均增加 serious infections;與未用者 PS-matched 比較,aHR 1.82–3.60,兒童相對風險最高且隨累積劑量上升。

不嘻嘻:corticosteroids 又在提高感染帳單,IBD 也逃不掉。


Cryptococcosis in immunocompromised patients without HIV infection: experience of a hospital in Chile

Authors: Diez de Medina C et al. | Journal: Rev Iberoam Micol | Date: 2026 Aug 28
DOI: 10.1016/j.riam.2026.05.002 | PMID: 42665049

TL;DR: 智利單院 2016–2025 年 31 例 cryptococcosis 中,7 例為 HIV-negative;5 例 cryptococcal meningitis、4 例神經外侵犯,30 天 cryptococcosis 相關死亡率 28.6%,多見於血液惡性腫瘤與 SOT。

不嘻嘻:HIV-negative cryptococcosis 仍很兇,免疫低下不給面子。


Research progress of lipoarabinomannan in the diagnosis of mycobacterium tuberculosis: diagnostic potential and new highlights of quantum dot technology

Authors: Yu Y et al. | Journal: Diagn Microbiol Infect Dis | Date: 2026 Aug 26
DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2026.117631 | PMID: 42664862

TL;DR: LAM 尿液檢測可作為 active TB 非侵入性 biomarker,HIV-positive 且 CD4 低者表現較佳;quantum dot 技術藉 signal amplification 將靈敏度提升至 fg/mL,具 point-of-care 潛力。

嘻嘻:尿液 LAM 若能更靈,TB 診斷會輕鬆不少。


Viral seropositivity in a Brazilian cohort of patients with multiple sclerosis: A retrospective descriptive study

Authors: Santiago-Amaral J et al. | Journal: J Neurol Sci | Date: 2026 Aug 25
DOI: 10.1016/j.jns.2026.126154 | PMID: 42664849

TL;DR: 巴西 70 名 MS 患者 viral serology 顯示 EBV IgG 95.1%、rubella 95.7%、varicella-zoster virus 87.5%、CMV 87.2%;anti-HBs 僅 45.2%,未見 HBsAg、HIV、HCV、HTLV-I/II 陽性。

嘻嘻:MS 門診補看 hepatitis B 免疫,這題很實用。


🟢 One Health / Zoonoses

Meteorological and environmental factors associated with the spatiotemporal risk of severe fever with thrombocytopenia syndrome in Japan: A prefecture-level time-series modeling study

Authors: Yan F et al. | Journal: One Health | Date: 2026 Dec
DOI: 10.1016/j.onehlt.2026.101547 | PMID: 42666519

TL;DR: 日本 2013–2025 年 1,237 例 SFTS time-series 顯示風險於 21.8°C(RR 1.78)與降雨 156.6 mm(RR 1.30)達峰,forest coverage 0.84 時 RR 6.58,反映氣象與環境可協助風險評估。

嘻嘻:天氣也能提醒 SFTS 風險,防疫雷達多一格。


A pleuromutilin-ciprofloxacin hybrid exhibits potent activity against Streptococcus suis

Authors: Zhou G et al. | Journal: Front Cell Infect Microbiol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fcimb.2026.1920241 | PMID: 42666492

TL;DR: pleuromutilin-ciprofloxacin hybrid PHC 對 Streptococcus suis 具 in vitro 與小鼠模型活性,可能同時干擾 DNA replication、protein synthesis,破壞 membrane integrity、membrane potential 並誘發 oxidative stress。

嘻嘻:PHC 打 S. suis 多點開花,新藥感有出來。


TFEB and MCOLN1 are important for Coxiella burnetii egress via lysosomal exocytosis

Authors: Rinkel S et al. | Journal: Front Cell Infect Microbiol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fcimb.2026.1835140 | PMID: 42666149

TL;DR: Coxiella burnetii infection 隨 CCV 變大活化 MCOLN1-dependent TFEB;LAMP1/2 缺失不影響複製但阻礙 egress,支持其經 lysosomal exocytosis 離開細胞且不誘發宿主細胞死亡。

嘻嘻Coxiella 逃跑路線被抓包,細胞生物學今天很會。


Histologic atlas of the Egyptian rousette (Rousettus aegyptiacus) with an integrated review of macroscopic anatomy

Authors: Elbert JA et al. | Journal: Vet Res | Date: 2026 Aug 27
DOI: 10.1186/s13567-026-01787-x | PMID: 42661218

TL;DR: 野外捕獲 Egyptian rousette 建立主要器官系統 histologic atlas,整合既有 macroscopic anatomy 與 histology,提供宿主病原互動、病理判讀與公共衛生監測的標準參考。

嘻嘻:果蝠有標準圖譜,病理判讀終於少一點通靈。


Characterization of spontaneous gross and histologic findings in free-ranging Egyptian rousettes (Rousettus aegyptiacus) from Uganda with a review of reported pathogens

Authors: Elbert JA et al. | Journal: Vet Res | Date: 2026 Aug 27
DOI: 10.1186/s13567-026-01785-z | PMID: 42661206

TL;DR: 烏干達 69 隻自由活動 Egyptian rousette 中,85.5% 有肉眼病灶、100% 有 microscopic alterations;共記錄 794 個病灶,肝臟與 multiorgan perivascular cellular aggregates 最常見(各 81.2%)。

不嘻嘻:野外果蝠全員有變化,背景雜訊直接開滿。


Microsporum canis Complex Infections in the United Arab Emirates: Clinical, Molecular, and Antifungal Susceptibility Profiles

Authors: Anes F et al. | Journal: Med Mycol | Date: 2026 Aug 29
DOI: 10.1093/mmy/myag091 | PMID: 42667404

TL;DR: 阿布達比 52 株 Microsporum canis complex 中,ITS sequencing 修正近 10% phenotypic identification;雖 MIC 普遍低,32 名追蹤患者有 81.2% 治療失敗或復發,MIC 與 outcome 無明確關聯。

不嘻嘻:MIC 很乖但病人不乖,皮癬菌照樣讓人加班。


Authors: Kasmi S et al. | Journal: Appl Environ Microbiol | Date: 2026 Aug 28
DOI: 10.1128/aem.01445-26 | PMID: 42663480

TL;DR: 歐洲 HEV ORF2 capsid hinge region 的 H354Y 與 H354Y-G357S-V364I motifs 分別連結 genotype 3 與 1;AlphaFold 與 peptide 實驗顯示可能改變 virion surface properties 與環境循環。

嘻嘻:HEV capsid 小鉸鏈,可能藏著環境存活密碼。


Top-down/bottom-up consortia achieve robust γ-HCH degradation and reduced methanogenic contribution in wetlands

Authors: Liu M et al. | Journal: Appl Environ Microbiol | Date: 2026 Aug 28
DOI: 10.1128/aem.01133-26 | PMID: 42663479

TL;DR: 兩組 non-obligate ODB consortia 在濕地 sediment microcosms 將 γ-HCH 降至 63.0% 與 56.1%,並顯著抑制 CO₂ reduction methanogenesis;Y13 組富集 pceA,且可能經 horizontal gene transfer 擴散。

嘻嘻:濕地微生物組隊拆污染,還順手壓低 methane。


Genomic characterization of non-CC398 methicillin-resistant Staphylococcus aureus from Belgian livestock reveals high similarity to human-associated lineages

Authors: Bogaerts B et al. | Journal: Front Public Health | Date: 2026
DOI: 10.3389/fpubh.2026.1894809 | PMID: 42661682

TL;DR: 比利時 2011–2021 年健康畜產動物 17 株 non-CC398 MRSA 分屬 ST1、ST22、ST80、ST239、ST612;ST22/ST239 具高 genomic similarity,且接近全球人類相關 lineages。

不嘻嘻:畜產 MRSA 越看越像人類老朋友,這友情太沉重。


A ribosomal marker-based metataxonomic framework for environmental surveillance of nematodes of public health importance

Authors: Zuluaga JP et al. | Journal: PLoS One | Date: 2026
DOI: 10.1371/journal.pone.0348689 | PMID: 42664231

TL;DR: 哥倫比亞安地斯地區 20 件水、污泥、農業 bioinputs 與食物樣本,以 18S rDNA V4 metataxonomics 偵測 25 個 mOTUs,涵蓋 Trichuris trichiuraEnterobius vermicularisAscaris spp.、Necator americanus 等公共衛生重要 nematodes。

嘻嘻:環境樣本抓 nematodes,公共衛生監測更有眼睛。


🟡 Food Security / Food Safety

Predictive modeling of lag time and growth phase of Listeria monocytogenes in ready-to-eat meat products

Authors: Singh M et al. | Journal: Int J Food Microbiol | Date: 2026 Aug 24
DOI: 10.1016/j.ijfoodmicro.2026.112026 | PMID: 42664771

TL;DR: 以 978 條 growth curves 建立 RTE 肉品 Listeria monocytogenes gamma-based model;logistic-with-delay validation 較準確,RLT lag time 法 R2 0.58–0.84、RMSE 0.779–1.190 ln(h),較少 fail-dangerous predictions。

嘻嘻:RTE 肉品風險模型變準,冰箱焦慮稍微降溫。


Overview of the re-evaluation of trace elements as nutritional feed additives in the European Union: characterization, safety, and efficacy

Authors: López-Gálvez G et al. | Journal: J Sci Food Agric | Date: 2026 Aug 29
DOI: 10.1002/jsfa.71021 | PMID: 42666066

TL;DR: 歐盟依 Regulation (EC) No 1831/2003 重新評估 8 種 trace elements 共 35 個飼料添加物,EFSA 於 2012–2019 年發布 33 份 scientific opinions,作為 9 項授權規章與淘汰決策基礎。

嘻嘻:飼料添加物重審有依據,監管不是只靠感覺。


Depuration Investigation on Parasites and Bacterial Loads in Freshwater Clam (Batissa violacea) and Oyster (Crassostrea gigas) Using a Sand Filter and UV Radiation

Authors: Singh AA et al. | Journal: J Food Sci | Date: 2026 Aug
DOI: 10.1111/1750-3841.71396 | PMID: 42665856

TL;DR: 斐濟淡水蛤與牡蠣 depuration 50 小時後,sand filter 加 UV 較 non-UV 更能降低 TPC、coliform、fecal coliform 與 Vibrio spp.;但對寄生蟲無效,仍需完整烹調與監測。

不嘻嘻:UV 能降菌卻打不動寄生蟲,最後還是要煮熟。


Hygiene practices among food vendors in urban, semi-urban, and rural Ghanaian settings: an ethnographic qualitative study

Authors: Norvivor FA et al. | Journal: Front Public Health | Date: 2026
DOI: 10.3389/fpubh.2026.1907787 | PMID: 42666345

TL;DR: 迦納 20 名都市、半都市與鄉村 food vendors 訪談與觀察顯示,自述衛生習慣與實際 hand hygiene、食物與金錢同時處理不一致;稽查多聚焦血液檢驗與 health card,較少評估攤販條件。

不嘻嘻:衛生自評很美,現場手部衛生又回到人性現實。


Can Organic Amendments Override Environmental Filtering of Soil Microbiomes? Evidence From 20 Years Old Agricultural Field Trials in Contrasting Tropical Sites

Authors: Visscher AM et al. | Journal: Glob Chang Biol | Date: 2026 Sep
DOI: 10.1111/gcb.71061 | PMID: 42667218

TL;DR: 肯亞 4 個約 20 年田間試驗顯示,土壤性質解釋 prokaryotic 與 fungal β-diversity 的 30% 與 28%;farmyard manure 可穩定改變群落,最乾旱貧瘠地點 ammonia-oxidizing bacteria 增加 30 倍。

嘻嘻:長期 manure 真的能改土壤菌相,不只是農業玄學。


Probiotic Properties and Physiological Activities of Lactic Acid Bacteria Isolated from Traditionally Fermented Raw Makgeolli

Authors: So YJ et al. | Journal: Prev Nutr Food Sci | Date: 2026
DOI: 10.3746/pnf.2026.042 | PMID: 42666892

TL;DR: 韓國順天 2024 年傳統 raw makgeolli 分離 70 株 LAB;Lactiplantibacillus plantarum MG1-6 模擬胃液存活率 >99%、膽汁環境耐受 80%,且所有菌株符合 EFSA antibiotic MIC 安全門檻。

嘻嘻:makgeolli 裡撈到硬派 LAB,益生菌候選很有戲。


Genotypic Profiling of Virulence and Antibiotic Resistance Genes of Escherichia coli Isolates Derived From Bovine Milk in the Dr. Kenneth Kaunda District, South Africa

Authors: Sizana LC et al. | Journal: Int J Microbiol | Date: 2026
DOI: 10.1155/ijm/7241123 | PMID: 42666668

TL;DR: 南非乳牛乳汁 65 株 E. coli 以 O128 為主(50.8%),fliC 62.5%、stx1 9.2%;對 amoxicillin/clavulanic acid 與 cephalothin 抗藥各 58.9%,98.5% 帶至少一個 resistance gene 但無 phenotypic MDR。

不嘻嘻:牛奶 E. coli 基因包很滿,餐桌前先深呼吸。


Knowledge, attitudes, and practices toward African swine fever among commercial pig farm producers in Takeo and Kampong Speu provinces, Cambodia

Authors: Chea B et al. | Journal: Front Vet Sci | Date: 2026
DOI: 10.3389/fvets.2026.1889657 | PMID: 42666630

TL;DR: 柬埔寨 76 個商業豬場對 ASF 預防多為中等知識(73.6%)與正向態度(89.4%),hygiene 與消毒遵從率 88.3%,但通報、訪客紀錄與應變準備仍不足。

不嘻嘻:biosecurity 最怕「大概有做」,病毒最愛這種縫。


Neutrophil depletion exacerbates Clonorchis sinensis associated hepatobiliary injury through expansion of Kupffer cells and Ly6Clo monocytes

Authors: Zhang B et al. | Journal: Food Waterborne Parasitol | Date: 2026 Sep
DOI: 10.1016/j.fawpar.2026.e00355 | PMID: 42666541

TL;DR: 小鼠感染 Clonorchis sinensis 14 天後,neutrophil depletion 加重 ALT/AST 上升、膽管傷害與 fibrosis,並擴增 Kupffer cells 與 Ly6Clo monocytes,呈 pro-inflammatory、pro-fibrotic 反應。

不嘻嘻C. sinensis 又提醒我們:免疫系統不是拆一塊就會乖。


Broad-spectrum lytic potential of endolysins derived from prophages of clinical Salmonella isolates

Authors: Liu Y et al. | Journal: Front Microbiol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fmicb.2026.1922952 | PMID: 42666351

TL;DR: 105 株臨床 Salmonella isolates 中鑑定 514 個 prophages,80.93% 帶 endolysin;候選 Lys2823 可裂解 outer-membrane-permeabilized Salmonella,具 biocontrol 與替代抗生素潛力。

嘻嘻:endolysin 來敲門,抗生素替補席終於有新面孔。


資料來源:PubMed (articles retrieved 2026-08-30)