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Daily Journal Digest — 2026-10-20

過去 24 小時新增：Transplant ID × 9、One Health × 11，共 20 篇。

⭐ 今日亮點

🔬 深入評讀

Generating Actionable Data From Antimicrobial Resistance Surveillance: Insights From the Fleming Fund's International Experience

Clin Infect Dis | IF 8.8 | DOI | PMID 42895838

  • 設計：敘述性綜整 Fleming Fund 的方案經驗、各國實作證據與已發表文獻，討論多國 One Health AMR surveillance 的建置與資料轉譯。
  • 樣本：涵蓋受 Fleming Fund 支援國家的監測實作經驗；摘要未提供國家數、病人數或可量化合併分析的樣本數。
  • 關鍵論點：實驗室基礎設施、人力、品質保證、資料系統與治理投資，伴隨常規 bacteriology、AST、參考與監測實驗室能力、EQA 參與及 GLASS 通報增加。作者指出臨床—實驗室介面、診斷可近性、數位分析能力與國內資金，是把監測資料轉為行動的關鍵。
  • Limitation：此為方案經驗與敘述性證據整合，未報告預先設定的系統性檢索、比較組或效果量，不能推論投資造成監測改善。各地代表性亦受基礎設施、供應鏈、人力流動與資料系統脆弱性限制。
  • Bottom line：AMR surveillance 的終點不該止於報表，而是建立能支持診斷、治療與政策決策的臨床—實驗室系統。

Fleming Fund Implementation in Kenya: What Have We Learned About Strengthening One Health Antimicrobial Resistance Surveillance for Decision-making?

Clin Infect Dis | IF 8.8 | DOI | PMID 42895841

  • 設計：以 2018 年為前 Fleming Fund 基線，整合肯亞國家與全球監測報告、Quadripartite 指標、治理與實作的質性證據，以及方案文件進行敘述性方案學習。
  • 樣本：聚焦肯亞的人類、動物與環境 AMR surveillance 系統；至 2025 年，據點由 2 個人類健康站擴展至合計 30 個跨部門站點。
  • 關鍵論點：國家報告已整合 AMR、antimicrobial consumption 與 antimicrobial use 資料，並以儀表板、報告及政策簡報支援 stewardship、infection prevention and control 與監管決策。WHO Joint External Evaluation 中的監測及多部門協調能力由 limited 提升至 demonstrated capacity，但摘要未提供病人結局或 AMR 盛行率改變。
  • Limitation：單一國家敘述性個案，無比較組，無法排除同期政策、資源投入與其他夥伴造成的影響。30 個據點並非全為人類健康站點，且長期運作仍仰賴可預期經費與常規資料使用。
  • Bottom line：肯亞經驗顯示跨部門監測擴張可行，但永續性取決於政府主導、資料使用與穩定財源，而非一次性能力建置。

Antimicrobial Resistance and One Health: Lessons on One Health Governance and Implementation from the Fleming Fund

Clin Infect Dis | IF 8.8 | DOI | PMID 42895837

  • 設計：反思 Fleming Fund 在 25 國設計與推行 One Health AMR 方案的經驗，提出治理與實作層面的可轉移教訓。
  • 樣本：涵蓋 25 國的方案治理與跨部門實作經驗；摘要未交代個別國家資料來源、樣本數、比較組或追蹤時間。
  • 關鍵論點：作者主張 One Health 應被視為可因地制宜的問題框架與行動方式，而非單一可交付成果。動物與環境部門的持續投資、明確編列跨部門協調成本、共同詮釋證據，以及正式治理與非正式專業網絡均被視為重要。
  • Limitation：這是反思性綜述，未呈現預先設定結局、系統性檢索或介入效果量，不能證明特定治理模式改善 AMR 或臨床結局。不同國家的制度、資源與政治條件差異，也限制直接複製。
  • Bottom line：One Health AMR 的核心工作是資助並維持跨部門共同解讀與行動的治理能力，而不只是把部門名稱放進同一份計畫。

🔴 Transplant & Opportunistic Infections

Not All Extrapulmonary Tuberculosis Is Equal: Site-Specific Mortality in a National Indian Cohort

Authors: Singh UB et al. | Journal: Clin Infect Dis | Date: 2026 Oct 19
DOI: 10.1093/cid/ciag677 | PMID: 42896148

TL;DR: 印度777,512名肺外結核成人治療期間死亡率依病灶相差逾10倍；結核性腦膜炎死亡勝算較淋巴結TB高12.48倍，miliary與心包膜TB分別為5.17及3.86倍。

不嘻嘻：肺外TB不是同一場考試，最怕抽到腦膜炎這張考卷。

A novel mycovirus identified in clinical isolates of Cryptococcus neoformans

Authors: Turk MN et al. | Journal: mBio | Date: 2026 Oct 19
DOI: 10.1128/mbio.02060-26 | PMID: 42895324

TL;DR: 自波札那6株HIV陽性隱球菌腦膜炎患者CSF分離的Cryptococcus neoformans檢出Totiviridae基因組；RT-PCR於3株驗證病毒持續存在，並辨識單一Totivirus物種的2種genotype。

嘻嘻：Cryptococcus neoformans 裡還藏著病毒，真菌宇宙又多一層彩蛋。

A quasi-experimental study evaluating the effectiveness of a male-specific tuberculosis screening and diagnosis intervention in Uganda (IGNITE)

Authors: Nidoi J et al. | Journal: BMC Public Health | Date: 2026 Jul 22
DOI: 10.1186/s12889-026-28658-6 | PMID: 42894177

TL;DR: 烏干達男性友善TB篩檢介入後，病例通報率顯著上升（RR 1.51，95% CI 1.03–2.22）；男性通報率高於女性（RR 1.50，95% CI 1.23–1.83），治療啟動率維持91.4%–100%。

嘻嘻：把篩檢做得對男性友善，終於有人願意走進診間。

Predictors of tuberculosis preventive therapy initiation among people living with HIV in the Volta region, Ghana

Authors: Mbiba F et al. | Journal: BMC Public Health | Date: 2026 Jul 23
DOI: 10.1186/s12889-026-28511-w | PMID: 42894157

TL;DR: 迦納Volta地區806名PLHIV中，620人符合TPT資格，僅236人（38.1%）啟動；具良好TPT知識者啟動勝算較高（aOR 6.79，95% CI 4.69–9.83）。

不嘻嘻：明明能預防卻只啟動三成，TB又贏在最後一哩路。

Activity of manogepix and comparator antifungal agents against uncommon filamentous fungal isolates collected in a global surveillance program

Authors: Winkler ML et al. | Journal: Microbiol Spectr | Date: 2026 Oct 19
DOI: 10.1128/spectrum.02559-26 | PMID: 42895337

TL;DR: 全球20國332株罕見filamentous fungi中，manogepix對多數Aspergillus、Fusarium、Scedosporium與Mucor的MEC50/90低於azoles及amphotericin B；僅Rhizopus較高，WT-UL為16 mg/L。

嘻嘻：manogepix 對罕見黴菌亮眼，抗黴菌藥櫃終於有新希望。

Tuberculosis Among Artisanal Miners in the Mulongo Health Zone, Democratic Republic of Congo: Unmatched Case-Control Study

Authors: Mutangala Muloye J et al. | Journal: JMIR Form Res | Date: 2026 Oct 19
DOI: 10.2196/93635 | PMID: 42896171

TL;DR: 剛果民主共和國Mulongo礦工病例對照研究中，貧窮（aOR 3.16）、HIV感染（aOR 4.65）及TB傳播、病因與診斷知識不足均與TB相關；擁擠居住僅呈邊緣相關（aOR 1.65）。

不嘻嘻：礦坑裡不只挖礦，還挖出貧窮與TB的老劇本。

Bilateral Cryptocococcal orbital cellulitis associated with sinonasal cryptococcosis: a case report and review of the literature

Authors: Kamgarpour H et al. | Journal: Orbit | Date: 2026 Oct 19
DOI: 10.1080/01676830.2026.2743832 | PMID: 42895769

TL;DR: 83歲糖尿病且近期使用corticosteroid的免疫低下男性，發生雙側orbital cellulitis合併廣泛sinonasal cryptococcosis；儘管接受抗微生物藥物、手術與全身性antifungal治療，仍因多重器官衰竭死亡。

不嘻嘻：隱球菌一路攻到眼眶，這份病例報告看得人眼眶也濕。

Incidence and Progression of Acute Kidney Injury Following Head and Neck Surgeries for COVID-19-Associated Mucormycosis: A Prospective Observational Study

Authors: Rapeti KM et al. | Journal: Cureus | Date: 2026 Sep
DOI: 10.7759/cureus.116469 | PMID: 42894582

TL;DR: 49名接受ROCM頭頸部清創的COVID-19-associated mucormycosis患者中，9人（18.4%）於術後5日內發生AKI；較低基線eGFR（p=0.03）及既有hypertension（77.8% vs. 32.5%，p=0.02）與AKI相關。

不嘻嘻：mucormycosis 清創後還得防AKI，臨床關卡一關接一關。

Long-acting injectables for global health: drug development considerations and applications in malaria and tuberculosis

Authors: Berlioz-Seux F et al. | Journal: Gates Open Res | Date: 2026
DOI: 10.12688/gatesopenres.16401.1 | PMID: 42892766

TL;DR: 專家工作坊提出long-acting injectable用於malaria與TB的開發重點，包括compound selection、formulation、PK/PD、安全性、毒理與regulatory pathways；強調pharmacometric工具及跨部門資料共享，以改善長療程服藥依從性。

嘻嘻：長效針劑若能成真，漫長療程終於不必全靠意志力撐住。

🟢 One Health / Zoonoses

Predicting unknown mammalian viral hosts with Dynamic Positive-Unlabeled learning

Authors: Pignalberi G et al. | Journal: Nat Commun | Date: 2026 Sep 17
DOI: 10.1038/s41467-026-76416-4 | PMID: 42894005

TL;DR: Dynamic Positive-Unlabeled learning整合觀察連結機率與真實連結分類器，預測5,330種哺乳類與33個病毒科的缺失宿主關聯；對新確認關聯的中位預測機率為0.82，估計總關聯數增加8.6倍。

嘻嘻：先猜到病毒下一個宿主，防疫終於有機會跑在疫情前面。

Fleming Fund Implementation in Kenya: What Have We Learned About Strengthening One Health Antimicrobial Resistance Surveillance for Decision-making?

Authors: Wesangula E et al. | Journal: Clin Infect Dis | Date: 2026 Oct 19
DOI: 10.1093/cid/ciag500 | PMID: 42895841

TL;DR: 肯亞AMR surveillance自2018年2個人類健康據點，擴展至2025年30個人類、動物與環境據點；國家報告整合AMR、antimicrobial consumption及use資料，但永續運作仍需可預期經費與常規資料運用。

嘻嘻：AMR監測站越織越密，肯亞終於能看見抗藥性的地圖。

The Fleming Fund: Key Features of Design and Approach to Strengthening Antimicrobial Resistance Surveillance in Low- and Middle-Income Countries

Authors: Shorten T et al. | Journal: Clin Infect Dis | Date: 2026 Oct 19
DOI: 10.1093/cid/ciag499 | PMID: 42895839

TL;DR: Fleming Fund自2015年承諾最高4.98億英鎊，於非洲及亞洲25國建置One Health AMR surveillance；第二期由資料產出轉向資料詮釋、傳播與政策運用，凸顯永續國家監測需長期協調與制度嵌入。

嘻嘻：監測資料開始走進政策，不再只是報告裡安靜的表格。

Generating Actionable Data From Antimicrobial Resistance Surveillance: Insights From the Fleming Fund's International Experience

Authors: Gupta-Wright A et al. | Journal: Clin Infect Dis | Date: 2026 Oct 19
DOI: 10.1093/cid/ciag497 | PMID: 42895838

TL;DR: Fleming Fund於支持國擴增routine bacteriology、antimicrobial susceptibility testing、external quality assessment及GLASS通報；但基礎設施、採購供應鏈、人力流動、資料系統與長期財源脆弱，仍限制AMR surveillance代表性與永續性。

不嘻嘻：儀器、人力、試劑都會斷線，AMR監測的續航比細菌還脆弱。

Antimicrobial Resistance and One Health: Lessons on One Health Governance and Implementation from the Fleming Fund

Authors: Abbas SS et al. | Journal: Clin Infect Dis | Date: 2026 Oct 19
DOI: 10.1093/cid/ciag517 | PMID: 42895837

TL;DR: Fleming Fund在25國的經驗指出，One Health應作為可因地制宜的問題架構與行動方式；須持續投資動物及環境部門、資助跨部門協調與共同證據詮釋，並結合正式治理及非正式專業網絡。

嘻嘻：One Health不是口號，肯跨部門坐下來就已經很不容易。

Evidence of Exposure to Highly Pathogenic Avian Influenza H5 Viruses in East Greenland Polar Bears

Authors: Buhler KJ et al. | Journal: Emerg Infect Dis | Date: 2026 Oct 13
DOI: 10.3201/eid3211.261050 | PMID: 42895460

TL;DR: 東格陵蘭北極熊於2024年14隻中3隻（21%）、2025年14隻中6隻（43%）檢出influenza A virus抗體；2025年4隻具有highly pathogenic avian influenza H5 clade 2.3.4.4b抗體，顯示暴露後存活。

嘻嘻：北極熊接觸H5後仍能存活，至少野外還留著一點好消息。

Global Genomic Surveillance of Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus

Authors: Otieno JR et al. | Journal: Emerg Infect Dis | Date: 2026 Oct 13
DOI: 10.3201/eid3211.260668 | PMID: 42895456

TL;DR: 彙整2012–2024年807株人類與駱駝MERS-CoV genomes，序列多來自沙烏地阿拉伯與阿拉伯聯合大公國；非洲及南、中亞仍有監測缺口，且常延遲多年公開提交。

不嘻嘻：病毒不等人，genome資料庫卻還在慢慢排隊。

Dynamics of Antimicrobial Resistant Bacteria in Water Environments: Risks via Surface Waters and Combating Strategies

Authors: Kussia GG et al. | Journal: Environ Microbiol | Date: 2026 Oct
DOI: 10.1111/1462-2920.70451 | PMID: 42893782

TL;DR: 綜述地表水中antimicrobials造成選擇壓力，經conjugation、transduction、transformation及新型HGT機制促進ARB與ARGs持續傳播；可考慮進階處理、constructed wetlands及phage-based remediation，但仍須評估安全性與擴充性。

不嘻嘻：河川成了抗藥性交流會，我們只能努力收拾。

Genomic characterization of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in Hyalomma ticks from Cameroon highlights circulation of the Africa 3 lineage

Authors: Namekong Fokeng A et al. | Journal: Parasit Vectors | Date: 2026 Jul 22
DOI: 10.1186/s13071-026-07560-5 | PMID: 42894234

TL;DR: 喀麥隆Ngaoundéré屠宰場自50頭牛採集299隻蜱、分為85 pools，4 pools檢出CCHFV RNA；1個H. rufipes pool的S與L segment序列歸入genotype III（Africa 3）。

不嘻嘻：蜱蟲又替CCHFV拓點，感染科的地圖愈畫愈大。

One Health determinants of clinically assessed cutaneous leishmaniasis in Sodo District, Ethiopia: a community-based cross-sectional study

Authors: Gazu L et al. | Journal: Acta Trop | Date: 2026 Oct 18
DOI: 10.1016/j.actatropica.2026.108375 | PMID: 42893759

TL;DR: 衣索比亞Sodo District 1,356人中，clinical assessed cutaneous leishmaniasis盛行率9.1%（123/1,356）；行為風險關聯最強（AOR 4.71，95% CI 3.44–6.71），模型AUC為0.92。

不嘻嘻：9.1%不是小數點誤會，而是社區正在承受的病。

Unveiling the long non-coding RNA profile of Aeromonas veronii-infected mouse abdominal macrophages

Authors: Song H et al. | Journal: Genomics | Date: 2026 Oct 18
DOI: 10.1016/j.ygeno.2026.111328 | PMID: 42893757

TL;DR: Aeromonas veronii 感染小鼠abdominal macrophages後，RNA sequencing辨識1,628個差異表現lncRNAs（680上調、948下調）；55個DElncRNAs可能透過41個target genes調控7條免疫途徑。

嘻嘻：A. veronii 的免疫調控線索，終於開始有脈絡可追。

資料來源：PubMed (articles retrieved 2026-10-20)