Skip to content

Daily Journal Digest — 2026-10-21

過去 24 小時新增：Transplant ID × 20、One Health × 14，共 34 篇。

⭐ 今日亮點

🔬 深入評讀

High-risk antimicrobial resistance genomic traits in multidrug-resistant Salmonella across China's food chain: projections to 2050

Nat Commun | IF 14.7 | DOI | PMID 42901977

  • 設計：中國 One Health 基因體監測研究，整合 MDR Salmonella enterica 全基因體、社會經濟、氣候、健康及抗菌藥物消耗資料；以機器學習風險分層及迴歸模型，推估至 2050 年的 trait-specific 趨勢。資料涵蓋 15 個省份、16 年，屬觀察性分析與模型預測，非介入研究。
  • 樣本：主要樣本為 2,536 株 MDR S. enterica，來源包括無症狀食品與非食品從業人員、腹瀉病人、豬肉、雞肉、家畜及農場環境；另納入同來源 306 株 non-MDR isolates 作系統發育比較。共辨識 88 個血清型與 80 個 ST，其中單相 S. Typhimurium 4,[5],12:i:- 占 19%、S. Typhimurium 占 18%，ST34 占 22%。
  • 關鍵數字：421 項 AMR genomic traits 中 88% 主要位於可移動元件，56.5% 被列為高風險，且單株最多帶有 24 項高風險 trait；食品從業人員的高風險 trait 比例經 10,000 次 bootstrap 校正後仍較食品來源高 7.0%（95% CI 3.4%–11.3%；p=0.0004），屬小至中等但穩健的富集。預測至 2050 年，blaCTX-M-64 與 blaTEM-1 可上升最多 20%，blaCTX-M-65 與 blaCTX-M-14 仍低於 5%，並預測 gyrA 87 下降而 plasmid-mediated qnrB17、qnrS1 上升。
  • Limitation：不同來源的樣本數、地區、採樣年代與宿主／暴露狀態不均衡，故食品從業人員與病人的比較易受混雜影響；即使與同一職業監測架構下的非食品從業人員直接比較，差異僅 2.35%（95% CI −1.68%–6.3%；p=0.31），未達統計顯著。社會經濟與抗菌藥物消耗變項多為國家層級相關資料，2050 年預測不能證明因果，也可能受未來政策、監測與菌株演化改變影響。
  • Bottom line：中國食品鏈 MDR Salmonella 的 AMR 多由可移動元件承載，食品從業人員是值得優先納入基因體與職業衛生監測的可能 reservoir，但預測結果應用於前瞻性監測與介入設計驗證，而非視為既定因果趨勢。
  • GRADE 證據等級：Very low ⊕◯◯◯

Int J Infect Dis | IF 3.1 | DOI | PMID 42901372

  • 設計：2017至2024年ICU成人回溯性世代研究，納入住院至少72小時者，以EORTC/MSGERC及FUNDICU定義proven／probable IPA，並以negative binomial與Cox模型分析年度趨勢及30日死亡。
  • 樣本：共11,707次ICU住院，135人符合共識IPA定義；其中55人（40.7%）沒有傳統宿主風險因子。
  • 關鍵數字：表觀IPA發生率每年上升（IRR 1.40，95% CI 1.06–1.85），但校正serum GM檢測強度後，年度IRR變為0.73（95% CI 0.54–0.98），而檢測強度與測得發生率強烈相關（IRR 6.15，95% CI 2.81–13.43）。無傳統風險者較少接受抗黴菌治療（12.7% vs. 67.5%），粗30日死亡較高（58.2% vs. 36.2%），但校正後死亡關聯不顯著（aHR 1.48，95% CI 0.82–2.66）。
  • Limitation：回溯性設計易受檢測指徵、病例辨識與殘餘混雜影響；serum GM檢測量未必等同完整診斷途徑，且135例事件限制死亡模型精確度，不能據此推論增加檢測或治療可改善預後。
  • Bottom line：解讀ICU IPA上升趨勢前，應先量化檢測密度；沒有傳統宿主風險不應自動降低診斷警覺。
  • GRADE 證據等級：Very low ⊕◯◯◯

Birth and clinical outcomes of pregnant participants with advanced HIV disease

J Acquir Immune Defic Syndr | DOI | PMID 42900018

  • 設計：這是 ENCORE（NCT05085171）務實型叢集隨機試驗中的前瞻性描述性次分析；試驗自 2022 年 5 月起於烏干達 Kampala 與 Wakiso 的 26 間門診 HIV 診所進行，本文納入至 2025 年 4 月 30 日的孕婦資料，評估機會性感染與出生結局。
  • 樣本：766 名晚期 HIV 女性參與者中，114 名（15%）懷孕；中位 CD4 為 124 cells/µL（IQR 82–170），HIV 診斷至納入中位 7 天，45% 尚未接受 ART。98/114（86%）妊娠足月；TPT 組 54 人、未接受 TPT 組 45 人、正接受活動性 TB 治療組 12 人。
  • 關鍵數字：研究期間 21/114（18%）發生至少 1 次機會性感染，其中 TB 佔 15/21（71%）；孕婦相較非孕女性的 CrAg 陽性率較低（2% vs 7%，p=0.023），TB LAM 陽性率亦較低（11% vs 28%，p<0.001）。TPT 組足月分娩率為 94%（51/54），高於未接受 TPT 組的 80%（36/45；OR 4.25，95% CI 1.07–16.80）及活動性 TB 治療組的 67%（8/12；OR 8.50，95% CI 1.60–45.25）；效應量看似大，但 CI 寬廣，估計精確度有限。
  • Limitation：此為嵌入式次分析，TPT、未接受 TPT 與活動性 TB 治療並非隨機分派，TB 病情及其他未量測的臨床或社會因子可能同時影響治療選擇與早產風險。各比較組樣本很小（尤其活動性 TB 組僅 12 人），且未提供調整後 OR、死胎／新生兒死亡或出生體重等完整出生結局，不能據此推論 TPT 的因果保護效果。
  • Bottom line：在烏干達晚期 HIV 孕婦中，TB 是最常見的機會性感染；應及早完成 TB 篩檢並在排除活動性 TB 後落實 TPT，但足月分娩的較高勝算仍需較大且經調整的研究確認。
  • GRADE 證據等級：Very low ⊕◯◯◯

🔴 Transplant & Opportunistic Infections

Evolution of chronic diseases and multimorbidity clusters among the deceased in rural northeast South Africa (2012-2022): insights from verbal autopsy data

Authors: Chironda CT et al. | Journal: BMC Public Health | Date: 2026 Jul 23
DOI: 10.1186/s12889-026-28636-y | PMID: 42897543

TL;DR: 南非東北農村5,892名死者中，2012至2022年高血壓盛行率由約25%升逾50%，糖尿病由10%增至約25%；TB則由23%降至11%。複雜多重共病由8%升至15%，疾病群集轉向心代謝疾病，老年與女性負擔最高。

不嘻嘻：TB退場後，心代謝共病立刻接棒加班。

Merkel cell polyomavirus DNA in CSF of paediatric patients with suspected meningitis or encephalitis

Authors: Hemmati N et al. | Journal: Virol J | Date: 2026 Jul 25
DOI: 10.1186/s12985-026-03261-8 | PMID: 42902299

TL;DR: 46名疑似病毒性腦膜炎或腦炎兒童中，6名（13.0%）CSF檢出MCPyV DNA，且全為HIV陽性（p=0.001）。MCPyV陽性者CSF淋巴球比例較高、蛋白較高、葡萄糖較低，意識改變較常見（83.3% vs. 37.5%）。

不嘻嘻：HIV兒童的腦炎鑑別診斷又多了一位難纏房客。

A Whole-blood Transcriptional Signature Associated With Obstructive Post-tuberculosis Lung Disease

Authors: Newby RE et al. | Journal: Open Forum Infect Dis | Date: 2026 Oct
DOI: 10.1093/ofid/ofag610 | PMID: 42898833

TL;DR: 301名新診斷PTB成人中，12個月時105名（50%）有PTLD，包括26名阻塞型與18名混合型。治療前全血mHR基因表現分數與6及12個月阻塞型PTLD相關（p=0.003、0.012），但與限制型肺病及Mtb aerosolization無關。

嘻嘻：治療前抽血，或許能先替PTLD拉警報。

Incidence and Predictors of QTC Prolongation Among Drug-Resistant Tuberculosis Patients Receiving Bedaquiline-Based TB Regimens in Uganda: A Countrywide Retrospective Cohort Study

Authors: Nasasira M et al. | Journal: Open Forum Infect Dis | Date: 2026 Oct
DOI: 10.1093/ofid/ofag637 | PMID: 42898576

TL;DR: 烏干達532名接受bedaquiline regimen的DR-TB患者，追蹤中位數10.3個月，QTc延長發生率為每1,000 person-months 12.0例（95% CI 10.8–16.8）。較低BMI與QTc延長相關（IRR 0.924，95% CI 0.860–0.993），但治療成功率未受影響。

不嘻嘻：DR-TB藥效要顧，心電圖也得一起值班。

Prevalence and determinants of metabolic abnormalities among adult tuberculosis patients at Gondar Town, Northwest Ethiopia: an institution-based comparative cross-sectional study

Authors: Chane E et al. | Journal: BMC Infect Dis | Date: 2026 Jul 23
DOI: 10.1186/s12879-026-14086-9 | PMID: 42902213

TL;DR: 衣索比亞260人比較中，TB患者至少1項代謝異常盛行率為48.46%，對照組為43.85%，差異未達顯著（p=0.455）。TB患者triglycerides、LDL-cholesterol與fasting blood glucose較高，HDL-cholesterol及BMI較低；45歲以上、女性與大量飲酒者為高風險群。

不嘻嘻：TB照護清單愈寫愈長，代謝問題也來報到。

Rhino-orbito-cerebral mucormycosis (ROCM) in eastern Iran: a six-year dual-center retrospective observational study of 329 patients

Authors: Bakhshaee M et al. | Journal: BMC Infect Dis | Date: 2026 Jul 22
DOI: 10.1186/s12879-026-13860-z | PMID: 42902156

TL;DR: 伊朗馬什哈德2家轉診醫院329名ROCM住院患者中，45.6%有糖尿病、51.1%曾接受immunosuppressive therapy，23.7%需ICU照護。56.8%使用L-AmB，院內死亡率30.4%；因缺乏嚴重度、手術及治療時序資料，無法比較各抗黴菌療法效果。

不嘻嘻：ROCM死亡率仍高，關鍵治療細節卻沒留下。

Clinical characteristics and outcomes of Candida auris in a tertiary intensive care unit: a four-year retrospective case series

Authors: Köşker CF et al. | Journal: BMC Infect Dis | Date: 2026 Jul 22
DOI: 10.1186/s12879-026-14028-5 | PMID: 42897507

TL;DR: 土耳其三級ICU於2023年9月至2024年12月辨識36名Candida auris患者，占同期1,517次住院的2.37%；77.8%由尿液、33.3%由血液培養檢出。所有患者皆有侵入性導管及廣效抗生素暴露，已檢測分離株的fluconazole MIC均>256 µg/mL。

不嘻嘻：C. auris進ICU後，fluconazole幾乎只能當背景音。

Authors: Choi CJ et al. | Journal: Int J Infect Dis | Date: 2026 Oct 20
DOI: 10.1016/j.ijid.2026.109202 | PMID: 42901372

TL;DR: 11,707次ICU住院中135人符合IPA定義，40.7%無傳統宿主風險因子。IPA測得發生率隨年度上升（IRR/year 1.40），但校正serum GM檢測強度後降為0.73；無傳統風險者抗黴菌治療較少（12.7% vs. 67.5%）、30日死亡率較高（58.2% vs. 36.2%）。

不嘻嘻：檢得愈勤病例愈多，真正的IPA趨勢仍待釐清。

Clinical correlates for fluconazole resistance in Candida bloodstream infections

Authors: Li Z et al. | Journal: Front Public Health | Date: 2026
DOI: 10.3389/fpubh.2026.1963129 | PMID: 42898588

TL;DR: 中國廣州94例Candida bloodstream infection中，Candida auris與Candida tropicalis的fluconazole抗藥率分別為68.42%與46.67%。C. auris抗藥與留置醫療裝置、antifungal及antibacterial使用相關；C. tropicalis則僅與手術史相關。

不嘻嘻：Candida的fluconazole抗藥性，愈看愈像老朋友。

IFN-γ-NOD2/IL-5-FCGR axis enhances eosinophil extracellular trap formation in allergic bronchopulmonary aspergillosis/mycosis

Authors: Sasaki H et al. | Journal: J Allergy Clin Immunol | Date: 2026 Oct 20
DOI: 10.1016/j.jaci.2026.09.027 | PMID: 42901294

TL;DR: ABPA/M患者血液eosinophils呈IFN-γ與IL-5訊號活化；airway eosinophils特異上調PD-L1，且需IFN-γ合併NOD2 ligand誘導。IFN-γ加NOD2 ligand或IL-5可增強IgG誘發、NADPH oxidase依賴的eosinophil extracellular trap formation，可能促成mucus plugging。

嘻嘻：eosinophil終於不只背鍋，也找到可追的機轉。

Efficacy and Safety of Isavuconazole

Authors: Kizaki Y et al. | Journal: J Infect Chemother | Date: 2026 Oct 20
DOI: 10.1016/j.jiac.2026.103102 | PMID: 42901250

TL;DR: 38名高IFI風險血液惡性腫瘤患者接受isavuconazole預防，中位使用119天；開始後100天內未出現breakthrough IFI，亦無IFI相關死亡。44.7%完成或持續治療，Grade ≥3不良事件與isavuconazole的因果關係未能確定。

嘻嘻：高風險宿主零突破感染，值得先記上一筆。

Unveiling Deep Mycoses: Histopathological Challenges in Diagnosing Deep Mycoses as a Neglected Tropical Disease

Authors: Adevita S et al. | Journal: Am J Dermatopathol | Date: 2026 Nov 01
DOI: 10.1097/DAD.0000000000003282 | PMID: 42900687

TL;DR: 印尼日惹39例疑似deep mycoses皮膚切片中，12例獲確認，8例為chromoblastomycosis；多為50歲以上從事農業男性的皮下感染。下肢verrucous plaques最常見，histopathology可藉muriform cells、grains及intracellular yeasts協助鑑別。

嘻嘻：病理切片仍是深部黴菌診斷的可靠偵探。

Application of machine learning to identify risk factors for bloodstream infections caused by different antimicrobial resistance phenotypes in chemotherapy patients

Authors: Villani Junior A et al. | Journal: Support Care Cancer | Date: 2026 Oct 20
DOI: 10.1007/s00520-026-11379-2 | PMID: 42900238

TL;DR: 1,220名化療患者的1,435次confirmed BSI中，83.1%為non-MDRO或fungaI pathogens，CR-GNB占7.6%。多標籤machine learning對CR-GNB辨識最佳，AUC-ROC 83.25%（95% CI 73.91%–91.64%）；既往CR-GNB感染為最強預測因子。

嘻嘻：machine learning若能早抓CR-GNB，抗生素或許少走冤枉路。

Birth and clinical outcomes of pregnant participants with advanced HIV disease

Authors: Nalintya E et al. | Journal: J Acquir Immune Defic Syndr | Date: 2026 Oct 20
DOI: 10.1097/QAI.0000000000003995 | PMID: 42900018

TL;DR: 烏干達766名advanced HIV女性中114名（15%）懷孕，18%在研究期間發生opportunistic infection，其中71%為TB。接受TPT者94%足月分娩，較未接受TPT者的80%有較高足月分娩勝算（OR 4.25，95% CI 1.07–16.80）。

嘻嘻：TPT不只防TB，母嬰結局也可能跟著受惠。

Disseminated Tuberculosis With Ocular Involvement After 12 Years of Anti-TNF-α Therapy

Authors: Muslimani MA et al. | Journal: Case Rep Ophthalmol Med | Date: 2026
DOI: 10.1155/crop/1351144 | PMID: 42898420

TL;DR: 52歲類風濕性關節炎女性使用adalimumab及methotrexate 12年後，儘管基線TB篩檢陰性或不確定，仍出現肺、脾臟及眼部播散性TB。bronchoalveolar lavage確認感染，雙側choroidal granulomas支持ocular TB；調整ATT、停用免疫抑制與加用corticosteroids後逐步改善。

不嘻嘻：Anti-TNF-α用到第12年，TB還是會突然來點名。

A multicenter study on the profile of fungal infections in children infected with HIV in tertiary hospitals in South Western Nigeria

Authors: Oyedeji OA et al. | Journal: Front Pediatr | Date: 2026
DOI: 10.3389/fped.2026.1812083 | PMID: 42898314

TL;DR: 175名HIV兒童中，47.4%有dermatophytosis、13.7%有IFI；12例死亡中9例歸因於IFI。未使用HAART及嬰兒的IFI較多，且Pneumocystis pneumonia與cryptococcal disease診斷資源不足。

不嘻嘻：IFI在孩子身上還是太兇，診斷工具卻還沒到位。

Comparative prognostic analysis of allogeneic hematopoietic stem cell transplantation regimens in the treatment of severe aplastic anemia

Authors: Lin T et al. | Journal: Front Immunol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fimmu.2026.1936533 | PMID: 42898257

TL;DR: 62名再生不良性貧血接受allo-HSCT後，中位追蹤38個月、12人死亡；MSD-HSCT與Haplo-HSCT的5年OS為76.8%與80.6%，無顯著差異。CA、FCA及FMA regimen的5年OS亦相近。

嘻嘻：Haplo-HSCT交出不輸MSD的成績單，選擇更有底氣。

Prevalence and associated factors of overweight/obesity and central obesity among adults receiving dolutegravir-based first-line treatment in health facilities at hawassa city administration, sidama region

Authors: Hirigo AT et al. | Journal: Obes Pillars | Date: 2026 Dec
DOI: 10.1016/j.obpill.2026.100340 | PMID: 42898198

TL;DR: 433名接受dolutegravir一線ART的HIV成人，overweight/obesity與central obesity盛行率分別為45.0%及49.7%。女性、逾40歲與缺乏身體活動具較高勝算，而轉用DTG及治療期間無顯著關聯。

不嘻嘻：HIV控制住了，體重這關又默默變成新考題。

Extracellular vesicle phenotypic patterns associated with CMV, EBV and HHV-6 reactivation after haploidentical transplantation with post-transplant cyclophosphamide

Authors: Lia G et al. | Journal: Front Immunol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fimmu.2026.1937675 | PMID: 42898153

TL;DR: 32名haploidentical HCT接受者中，CMV、EBV及HHV-6 reactivation分別發生於20、11及17人。不同EV surface marker patterns與各病毒reactivation相關，校正aGVHD及合併病毒感染後仍顯著，尚待驗證其預測價值。

嘻嘻：EV或許能替病毒reactivation提早亮紅燈。

Addition of thiotepa to total body irradiation-based conditioning in allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for relapsed/refractory acute leukemia and lymphoma: a propensity score-matched retrospective study

Authors: Li M et al. | Journal: Ann Hematol | Date: 2026 Jul 24
DOI: 10.1007/s00277-026-07198-4 | PMID: 42897391

TL;DR: 傾向分數配對後，TBI＋thiotepa組48人、TBI組86人，OS與DFS相近；1年relapse cumulative incidence為6.7%比17.8%（sHR 0.280）。但僅3例relapse，且TBI＋thiotepa的mucositis較高（81.2%比64.0%）。

不嘻嘻：relapse訊號很美，但mucositis先來收利息。

🟢 One Health / Zoonoses

High-risk antimicrobial resistance genomic traits in multidrug-resistant Salmonella across China's food chain: projections to 2050

Authors: Baker M et al. | Journal: Nat Commun | Date: 2026 Oct 20
DOI: 10.1038/s41467-026-78346-7 | PMID: 42901977

TL;DR: 中國15省、16年間2,536株MDR Salmonella genome分析預測，84項高風險AMR traits至2050年可能上升；blaCTX-M-64與blaTEM-1最高可增20%。食品從業人員的trait盛行率高於食品來源，並帶有部分last-resort resistance genes。

不嘻嘻：食物鏈的抗藥性劇本，竟然已寫到2050年。

Molecular and environmental indicators of Listeria monocytogenes persistence in food processing facilities: a multi sector approach

Authors: Bellay M et al. | Journal: Food Microbiol | Date: 2027 Mar
DOI: 10.1016/j.fm.2026.105275 | PMID: 42901679

TL;DR: 9座食品加工廠1,097件環境檢體中，114件檢出Listeria monocytogenes，辨識出13個persistent clusters、共67株。persistence與高總菌數及相對濕度逾80%相關，並富集prophage、transport及stress response loci。

不嘻嘻：潮濕角落養出常駐班底，食品廠真的不能鬆懈。

Persistence of hepatitis A virus in a hydroponic nutrient solution at different temperatures

Authors: Jerkovic E et al. | Journal: Food Microbiol | Date: 2027 Mar
DOI: 10.1016/j.fm.2026.105319 | PMID: 42901672

TL;DR: HAV在hydroponic nutrient solution於4、15、20及25°C存放21天後仍具感染力，減少0.22–3.34 log PFU/mL。4°C persistence最高，D-value為41.34±4.06天，明顯長於15–25°C的6.31–9.23天。

不嘻嘻：冰箱不是HAV的墳墓，反而像長租套房。

Non-destructive and quantitative estimation of microbial growth rates on food surfaces using microscopic image analysis

Authors: Tamiya H et al. | Journal: Food Microbiol | Date: 2027 Mar
DOI: 10.1016/j.fm.2026.105317 | PMID: 42901670

TL;DR: 以顯微影像的bounded area時序擴張估算單一colony growth rate，再整合為族群生長速率，可捕捉Leuconostoc mesenteroides的溫度依賴生長。於ham model所得速率亦與plate count method一致，且可non-destructive監測。

嘻嘻：不必破壞樣本也能追菌長多快，監測更優雅了。

The application progress of detection technology for Bacillus cereus in food: Challenges, innovations and future prospects

Authors: Zhang Y et al. | Journal: Food Microbiol | Date: 2027 Mar
DOI: 10.1016/j.fm.2026.105310 | PMID: 42901663

TL;DR: 此綜述比較食品中Bacillus cereus的傳統、immunology、molecular biology與MALDI-TOF-MS檢測技術之優缺點。CRISPR/Cas結合RPA、LFA或AI可提升detection rate與accuracy，具早期食品安全監測潛力。

嘻嘻：CRISPR替食品安全加裝雷達，早點抓到就少點驚喜。

A quasi-metagenomics approach for subspecies level differentiation of Listeria monocytogenes in foods based on assembly alignment discrepancies

Authors: Lau CH et al. | Journal: Food Microbiol | Date: 2027 Mar
DOI: 10.1016/j.fm.2026.105308 | PMID: 42901661

TL;DR: quasi-metagenomics以enrichment sequencing區分食品中的L. monocytogenes strain，當reference genome proportional coverage達≥10%時可偵測非相同strain的assembly差異。microgreens污染模型證實可在分離培養前提供初步genomic fingerprint。

嘻嘻：分離培養前先看見strain輪廓，溯源速度有望加快。

High persistence of hepatitis A and E viruses during simulated gastrointestinal digestion across diverse food matrices

Authors: Levasseur M et al. | Journal: Food Microbiol | Date: 2027 Mar
DOI: 10.1016/j.fm.2026.105307 | PMID: 42901660

TL;DR: HAV與HEV在berries、oysters、lettuce及pork liver pâté中，經INFOGEST 2.0或TIM-1模擬消化後的病毒量均與起始濃度相近。各時間點雖有小幅變化但無統計顯著差異，顯示兩病毒於腸胃道條件下高度persistence。

不嘻嘻：腸胃道這關沒能攔住HAV與HEV，病毒很會過關。

Serum metaviromic profiling of yaks and Tibetan sheep provides a pre-harvest viral baseline for food-producing ruminants

Authors: Guo Z et al. | Journal: Food Microbiol | Date: 2027 Mar
DOI: 10.1016/j.fm.2026.105301 | PMID: 42901654

TL;DR: 712份yak及Tibetan sheep血液組成142個serum library，取得28.7億raw reads，其中2,634萬條歸入viral taxa。yak的viral richness與diversity較高；結果提供高海拔畜牧系統serum virome baseline，但不代表食物污染或傳播。

嘻嘻：先把背景雜訊畫清楚，之後找異常才有依據。

Efficacy of cleaning and disinfection procedures for controlling Campylobacter contamination in broiler chicken sheds

Authors: Kingsbury JM et al. | Journal: Food Microbiol | Date: 2027 Mar
DOI: 10.1016/j.fm.2026.105283 | PMID: 42901644

TL;DR: 4座broiler chicken shed清潔消毒後，Campylobacter陽性率由22%（71/320）降至1%（3/320）。未見相鄰flock strain carryover的genomic證據，反而支持同期不同shed間傳播，顯示應優先阻斷farm內再引入與高風險介面。

嘻嘻：消毒確實有效，下一關是堵住農場內的串門子。

Discriminatory ability of WL Nutrient Agar for yeasts associated with olive environments: a binary scoring and machine learning approach

Authors: Parente E et al. | Journal: Food Microbiol | Date: 2027 Mar
DOI: 10.1016/j.fm.2026.105282 | PMID: 42901643

TL;DR: 227株橄欖環境yeast以WLNA colony features分類，初始machine learning accuracy僅0.51–0.65。排除operator disagreement較高的character並將Pichia species合併至genus後，Random Forest accuracy升至0.72，適合作為molecular identification前的低成本screening。

嘻嘻：低成本篩檢先上場，分子鑑定就能更省力。

Cold-induced transcriptomic responses are associated with strain-dependent Salmonella enterica persistence in refrigerated lettuce leaves

Authors: Rodríguez-Alvarez Y et al. | Journal: Food Microbiol | Date: 2027 Mar
DOI: 10.1016/j.fm.2026.105327 | PMID: 42901640

TL;DR: 11株Salmonella enterica在10°C萵苣葉內持續性差異顯著；Montevideo與Newport兩株在4°C亦呈相反表型。Montevideo於4°C生長力較高，cold stress後誘導general stress、cold-shock及envelope integrity相關基因較明顯。

嘻嘻：冷藏葉菜風險原來還得看菌株個性。

Genomic epidemiology of Salmonella from retail chicken meat in Japan: decline in pESI-like plasmid-harboring S. Infantis ST32 and predominance of S. Schwarzengrund ST241

Authors: Ishihara K et al. | Journal: J Food Prot | Date: 2026 Oct 20
DOI: 10.1016/j.jfp.2026.100948 | PMID: 42901407

TL;DR: 2023年日本150件零售雞肉中，S. Schwarzengrund占42.7%，S. Infantis僅7.3%。ST241冬季檢出率66%高於夏季31%（P<0.001），東日本47.1%亦高於西日本29.4%（P=0.042）。

不嘻嘻：雞肉裡換了主角，食安劇本仍是熟悉那一套。

Tracking Illnesses Caused by Four Foodborne Pathogens Over Four Decades of the Healthy People Initiative

Authors: Louis RP et al. | Journal: J Food Prot | Date: 2026 Oct 20
DOI: 10.1016/j.jfp.2026.100942 | PMID: 42901406

TL;DR: 美國Healthy People以FoodNet追蹤四種foodborne pathogens，資料涵蓋1987至2024年；各十年目標、baseline、target及進度分類方法均持續演變。跨年代比較感染趨勢時應審慎，避免將不同測量架構直接比對。

不嘻嘻：指標一直換，四十年趨勢別硬比。

Exploring synergistic effect of bacteriophages with probiotics against multidrug resistant Salmonella Typhimurium in a simulated chicken gastrointestinal system using metagenomic- and culturomic approaches

Authors: Choi Y et al. | Journal: J Anim Sci Technol | Date: 2026 Jul
DOI: 10.5187/jast.2025.e30 | PMID: 42898572

TL;DR: 模擬雞隻腸胃道中，bacteriophages SLAM_phiST45/56可降低multidrug resistant S. Typhimurium，但使Clostridium perfringens增加。合併Lactobacillus reuteri J2M1可緩解此效應並促進Oscillibacter與Clostridium butyricum，仍須in vivo驗證。

嘻嘻：bacteriophage 與益生菌聯手，腸道生態總算有人顧了。

資料來源：PubMed (articles retrieved 2026-10-21)