Daily Journal Digest — 2026-10-28¶
過去 24 小時新增：Transplant ID × 30、One Health × 15，共 45 篇。
⭐ 今日亮點¶
- Pneumocystis jirovecii Pneumonia in Critical Care: Evolving Host Populations, Diagnostic Uncertainty, and Management Controversies
重症非 HIV PJP 的診斷與治療不確定性，直接影響高風險宿主照護。 - Adoptive Virus-Specific T Cell Therapy for Viral Infections After Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation: Current Strategies and Future Perspectives
整合 allo-HSCT 病毒免疫治療的證據與落地障礙，具前瞻性。 - Food- and Waterborne Bacteria Transmission and Antimicrobial Resistance Under Climate Change: Evidence Gaps in Mainland Portugal
把氣候衝擊、AMR 與監測缺口連成可行動的 One Health 框架。
🔬 深入評讀¶
Pneumocystis jirovecii Pneumonia in Critical Care: Evolving Host Populations, Diagnostic Uncertainty, and Management Controversies¶
Microorganisms | DOI | PMID 42943609
- 設計：敘述性綜述，聚焦重症成人 PJP 的流行病學、診斷、治療、預防與預後。
- 樣本：涵蓋惡性腫瘤、實體器官與造血幹細胞移植、自體免疫疾病及使用 corticosteroids 等免疫低下族群；摘要未交代系統性檢索範圍或納入研究數。
- 關鍵論點：PCR 單獨無法區分定植與活動性感染，應結合宿主因子、影像、serum β-D-glucan 與顯微鏡；trimethoprim-sulfamethoxazole 仍是首選，但非 HIV PJP 輔助 corticosteroids 的觀察性資料相互矛盾，首個 RCT 未證實明確死亡率效益。
- Limitation：未說明系統性搜尋、文獻篩選或偏差評估方法；各診斷策略與治療研究的宿主、疾病嚴重度及 outcome 異質性高。
- Bottom line：遇到免疫低下重症呼吸衰竭時，PJP PCR 必須置於整體臨床脈絡判讀，非 HIV 病人的輔助 corticosteroids 不應視為已有定論。
Adoptive Virus-Specific T Cell Therapy for Viral Infections After Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation: Current Strategies and Future Perspectives¶
Biomolecules | DOI | PMID 42939718
- 設計：敘述性綜述，回顧 allo-HSCT 後 virus-specific T cell adoptive transfer 的發展、製備策略、臨床證據及未來方向。
- 樣本：涵蓋 CMV 為主，並納入 EBV、AdV、多病原產品及第三方供者策略；摘要未提供檢索年代、納入研究數或各研究樣本數。
- 關鍵論點：文章主張 virus-specific T cells 可重建病原特異性免疫，並以降低 alloreactivity 與 GvHD 風險為設計目標；重點瓶頸在產品標準化、即時取得性、免疫監測，以及與現代抗病毒預防和 graft engineering 的整合。
- Limitation：未交代系統性搜尋與品質評估；不同產品來源、製程、病毒標的、適應症及併用抗病毒策略差異大，難直接比較療效與持續性。
- Bottom line：對反覆或難治病毒感染的 allo-HSCT 病人，virus-specific T cell therapy 是值得及早轉介討論的免疫重建策略，但常規導入仍受供應與標準化限制。
Food- and Waterborne Bacteria Transmission and Antimicrobial Resistance Under Climate Change: Evidence Gaps in Mainland Portugal¶
Microorganisms | DOI | PMID 42943470
- 設計：以葡萄牙本土為案例的敘述性 One Health 綜述，整合臨床、食物鏈、動物、野生動物與環境研究，探討氣候變遷下食源性與水源性細菌及 AMR。
- 樣本：涵蓋 Salmonella spp.、致病性 Escherichia coli、Vibrio spp.、Listeria monocytogenes、Shigella spp. 與 Yersinia enterocolitica；摘要未提供檢索方法、研究數或可統合的效應量。
- 關鍵論點：升溫與細菌生長及季節性改變相關，暴雨與洪水可藉逕流及沉積物再懸浮增加糞便污染，乾旱則可能濃縮微生物負荷並改變用水暴露；將氣候變數、AMR 與 genomic 資料連結的研究仍不足。
- Limitation：以單一地區為主，證據多為不同來源的觀察性研究；暴露定義、採樣架構與 AMR/genomic 資料不一致，無法據此量化因果效應。
- Bottom line：AMR 監測應把氣候與極端天氣納入 longitudinal One Health 資料架構，否則難提前辨識食水傳播風險。
🔴 Transplant & Opportunistic Infections¶
Factors associated with severe disease and in-hospital mortality in children with non-HIV-associated Pneumocystis jirovecii pneumonia: a single-center retrospective cohort study¶
Authors: Ning J et al. | Journal: Front Cell Infect Microbiol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fcimb.2026.1937817 | PMID: 42935836
TL;DR: 61名非HIV兒童PJP中30例（49.2%）為重症、9例（14.8%）院內死亡。LDH每增100 U/L與重症相關（aOR 1.532），423 U/L鑑別重症的敏感度90.0%、特異度71.0%。
不嘻嘻：小朋友的PJP也不好惹，LDH又得加班了。
Successful management of histoplasmosis with novel triazole antifungals: a brief report¶
Authors: Concha Fuentes C et al. | Journal: J Antimicrob Chemother | Date: 2026 Oct 06
DOI: 10.1093/jac/dkag370 | PMID: 42944774
TL;DR: 巴塞隆納6例確診histoplasmosis以posaconazole或isavuconazole治療，中位療程11.75個月；5例先接受liposomal amphotericin B。全部達完全臨床、影像及／或黴菌學反應，追蹤1–5年未見毒性或復發。
嘻嘻：新一代triazole替histoplasmosis撐起長期後援。
Droplet digital PCR for diagnosing invasive aspergillosis in hematological malignancies: a prospective cohort study¶
Authors: Bitterman R et al. | Journal: J Clin Microbiol | Date: 2026 Oct 27
DOI: 10.1128/jcm.01140-26 | PMID: 42937364
TL;DR: 203名血液惡性腫瘤患者中26例（12.8%）為probable/proven IA；BALF上清液ddPCR表現最佳，AUC 0.88、敏感度0.65、特異度0.96。未先用mold-active抗黴菌藥者AUC升至0.95，EBC ddPCR效能不佳。
嘻嘻：BALF ddPCR夠準，早點抓到黴菌很可以。
Efficacy and Safety of Adoptive BK Polyomavirus-Reactive T-Cell Therapy for Active Infection or Disease in Transplant Recipients: A Systematic Review¶
Authors: Bratosin F et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Oct 20
DOI: 10.3390/v18101166 | PMID: 42944085
TL;DR: 15個獨立cohort共241名BKPyV感染或疾病移植受者，178人（73.9%）依各研究定義有反應，合併反應率87%（95% CI 73–97）。證據多為非對照且重疊，尚未證實臨床療效或移植物效益。
嘻嘻：BKPyV-specific T cells看來有戲，等對照試驗開獎。
The Gut Virome in Gastrointestinal Cancers: Mechanisms, Biomarkers, and Translational Opportunities¶
Authors: Ghidini M et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Oct 12
DOI: 10.3390/v18101131 | PMID: 42944051
TL;DR: 腸道virome可能經噬菌體重塑細菌群落、基因轉移及調節發炎而影響消化道癌；大腸癌已有多個cohort顯示phage多樣性與網絡改變及糞便診斷訊號。惟檢體與分析異質性高、因果證據及外部驗證仍不足。
嘻嘻：腸道phage可能是癌症微生物群的隱藏編劇。
Monitoring hCMV-specific T cell response in hematopoietic stem cell transplant recipients via rapid whole blood cytokine release assay¶
Authors: Yuen N et al. | Journal: J Virol | Date: 2026 Oct 27
DOI: 10.1128/jvi.00883-26 | PMID: 42937341
TL;DR: 以whole blood IFN-γ／IL-2 cytokine release assay量測hCMV-specific T cells，在40名健康者及20名HSCT受者驗證，與IFN-γ ELISpot高度相關。該法在HSCT受者偵測靈敏度較高，且可反映hCMV reactivation期間免疫反應變化。
嘻嘻：一管全血追hCMV免疫，臨床很想要這種方便。
Modeling the Epstein-Barr virus lifecycle in the rabbit¶
Authors: Burgess CK et al. | Journal: J Virol | Date: 2026 Oct 27
DOI: 10.1128/jvi.01256-26 | PMID: 42937340
TL;DR: 免疫抑制兔感染EBV後出現脾臟廣泛感染、脾腫大及濾泡形成改變；B95-8與Akata感染量相近。兔可於6個月內產生EBNA抗體反應，Akata感染較一致，但EBV持續感染及完整life cycle仍待確認。
嘻嘻：兔兔加入EBV研究陣容，但劇本尚未演完。
Integrated transcriptome and mitochondrial respiratory activity analysis reveals oxidative stress adaptation in azole-resistant Aspergillus fumigatus¶
Authors: Feilan Z et al. | Journal: Microbiol Spectr | Date: 2026 Oct 27
DOI: 10.1128/spectrum.00134-26 | PMID: 42937300
TL;DR: 4株azole-resistant Aspergillus fumigatus 在voriconazole壓力下出現廣泛轉錄重編程與oxidative stress路徑變化。代表株SHJT42B的Complex I、III活性下降且ROS升高，提示粒線體呼吸改變可能參與azole resistance適應。
不嘻嘻：A. fumigatus連粒線體都拿來練抗藥性。
Determinants of unsuccessful tuberculosis treatment outcomes among patients under facility-based directly observed therapy (DOT) follow-up in Rwanda (2021-2023): a retrospective analysis of national surveillance data¶
Authors: Richard K et al. | Journal: BMC Infect Dis | Date: 2026 Jul 31
DOI: 10.1186/s12879-026-14148-y | PMID: 42947036
TL;DR: 盧安達9,149名接受facility-based DOT的TB患者中，11%治療未成功，死亡占8%。HIV coinfection增加死亡（aOR 2.99）及失訪（aOR 2.42）風險；60歲以上死亡風險亦升高（aOR 2.80）。
不嘻嘻：TB合併HIV依然是老牌難關，沒有驚喜。
The Aspergillus fumigatus septation components Bud4 and Rho4 are essential for virulence¶
Authors: Guruceaga X et al. | Journal: Infect Immun | Date: 2026 Oct 27
DOI: 10.1128/iai.00315-26 | PMID: 42937459
TL;DR: 刪除Aspergillus fumigatus Bud4或Rho4會完全失去hyphal septation，並使小鼠IPA模型失去virulence與組織侵入性。兩種突變亦將echinocandin活性由static轉為cidal，部分抑制septation即可提高echinocandin敏感性。
嘻嘻：找到septation弱點，echinocandin終於有新搭檔。
Cytomegalovirus Donor and Recipient Serostatus and 5-Year Mortality After Heart Transplantation: Evidence of Racial Differences¶
Authors: Abidi MZ et al. | Journal: Transpl Infect Dis | Date: 2026 Oct 27
DOI: 10.1111/tid.70341 | PMID: 42937066
TL;DR: 2010–2024年首次成人心臟移植資料顯示，CMV D+/R−及D+/R+與5年死亡增加相關。相較白人，黑人受者CMV血清狀態相關死亡效應較弱，例如D−/R−對D+/R+之sHR低0.69（95% CI 0.57–0.84）。
不嘻嘻：心臟移植後CMV的長期帳，還是得慢慢算。
Atovaquone prophylaxis against Pneumocystis jirovecii pneumonia in immunosuppressed patients with autoimmune rheumatic diseases: Incidence and clinical characteristics of a breakthrough case-A retrospective cohort study¶
Authors: Takase T et al. | Journal: J Infect Chemother | Date: 2026 Oct 27
DOI: 10.1016/j.jiac.2026.103116 | PMID: 42946328
TL;DR: 128名接受atovaquone 1,500 mg/day預防的自體免疫風濕病患者，中位觀察147天僅1例PCP，發生率0.69／100 person-years（95% CI 0.02–3.83）。突破感染前營養配方脂肪由20 g降至6.7 g，可能影響吸收。
嘻嘻：atovaquone大致可靠，但別讓低脂餐扯後腿。
Clinical Utility of Plasma Microbial Cell-Free DNA Sequencing in Adult Immunocompromised Patients: A Real-World Cohort Study¶
Authors: Charles DW et al. | Journal: Am J Med Sci | Date: 2026 Oct 27
DOI: 10.1016/j.amjms.2026.10.011 | PMID: 42946251
TL;DR: 98名免疫低下成人中，plasma mNGS有62%陽性，但僅32%帶來正向臨床影響，與傳統微生物檢驗一致者30%。66%未影響治療，discordant陽性常屬possible或unlikely infection，invasive mold與NTM感染可為偽陰性。
不嘻嘻：mNGS陽性不等於答案，臨床判讀仍要值班。
Revisiting the use of adenosine deaminase in cerebrospinal fluid analysis for infectious meningoencephalitis¶
Authors: Farias LABG et al. | Journal: Arq Neuropsiquiatr | Date: 2026 Nov
DOI: 10.1055/s-0046-1829158 | PMID: 42946005
TL;DR: 206名接受CSF-ADA檢測者中，Mycobacterium tuberculosis與Neisseria meningitidis感染的CSF-ADA較非CNS感染對照高。以5.5 IU/L診斷M. tuberculosis敏感度61.2%、特異度72.4%，可作TBM輔助診斷而非可靠單獨標記。
不嘻嘻：CSF-ADA仍是配角，別急著讓它獨挑大樑。
Candidozyma auris in hospital setting: Molecular characterization of clinical and environmental strains¶
Authors: Caggiano G et al. | Journal: J Infect Public Health | Date: 2026 Oct 23
DOI: 10.1016/j.jiph.2026.103404 | PMID: 42945854
TL;DR: 義大利普利亞醫院194份環境拭子中50份檢出C. auris DNA，ICU病人區被動空氣採樣33.3%陽性；66名篩檢者皆陰性，另2名病人拭子陽性。分離株對amphotericin B、anidulafungin敏感、對fluconazole抗藥，且與對應病人株基因相近。
不嘻嘻：Candidozyma auris已在ICU環境安家，清消要更拚。
KmerSignificance score: A discriminative and biologically informed framework for viral k-mer prioritization¶
Authors: Lebatteux D et al. | Journal: PLoS Comput Biol | Date: 2026 Oct 27
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1014332 | PMID: 42945372
TL;DR: KmerSignificance Score整合病毒株辨識、胺基酸替換影響與蛋白註解；辨識成分平均F1為0.881，與最佳chi-squared的0.876無顯著差異。於27.9萬筆SARS-CoV-2、HIV-1及HCMV序列中，高排名k-mer對應既有變異標記。
嘻嘻：k-mer終於不只會排名，還開始懂病毒生物學。
Dietary Pieris japonica Leaf Powder Enhances Hepatic Antioxidant Capacity, Modulates Cecal Microbiota, and Improves Eggshell Thickness in Laying Hens¶
Authors: Wu Y et al. | Journal: Vet Sci | Date: 2026 Oct 19
DOI: 10.3390/vetsci13101116 | PMID: 42944210
TL;DR: 360隻產蛋雞隨機接受0–0.20% Pieris japonica葉粉10週；0.05%組蛋殼厚度增加，補充組肝臟T-AOC、CAT、SOD及GSH-Px均上升。0.10%組改善十二指腸V/C並改變盲腸菌相，但0.20%對蛋相關指標有不良影響。
嘻嘻：蛋雞吃對葉子，連蛋殼都替牠們發聲。
New Organic Compounds Against Scedosporium and Mucorales: Antifungal Activity and Mechanisms of Cell Wall and Membrane Disruption¶
Authors: Rollin-Pinheiro R et al. | Journal: Molecules | Date: 2026 Oct 15
DOI: 10.3390/molecules31203691 | PMID: 42943761
TL;DR: 8種合成有機化合物中，化合物2對Scedosporium aurantiacum及Rhizopus oryzae活性最佳，MIC為12.5–25 μg/mL；化合物3、4為50–100 μg/mL。各化合物具fungistatic作用，抑制發芽與biofilm，並破壞細胞壁及膜完整性。
嘻嘻：對付難纏黴菌，多幾張新底牌總是好事。
A Host-Mimicking Peanut-Based Selective Medium Enhances Isolation, Sporulation, and Metabolomic Profiling of Aspergillus flavus¶
Authors: Nganguem Nzalle YB et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Oct 19
DOI: 10.3390/microorganisms14102391 | PMID: 42943629
TL;DR: 花生與玉米選擇性培養基較PDA及SDA提升Aspergillus flavus回收、生長及sporulation，效果跨不同來源菌株可重現。LC-MS/MS顯示培養基與菌株來源會改變代謝表型；臨床株結果僅來自1株，仍待擴大驗證。
嘻嘻：讓 A. flavus 回到花生主場，培養皿也更誠實。
Pneumocystis jirovecii Pneumonia in Critical Care: Evolving Host Populations, Diagnostic Uncertainty, and Management Controversies¶
Authors: Naito A et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Oct 16
DOI: 10.3390/microorganisms14102372 | PMID: 42943609
TL;DR: 重症PJP患者族群已擴及惡性腫瘤、移植、自體免疫疾病及接受corticosteroids者；呼吸道PCR須結合宿主因子、影像、β-D-glucan與顯微鏡判讀。Trimethoprim-sulfamethoxazole仍為首選，但非HIV PJP的輔助corticosteroids死亡效益未定。
不嘻嘻：PJP宿主愈來愈多元，診療卻還得靠臨床直覺硬撐。
Clinical Characteristics of Coccidioidomycosis in Patients with Hepatitis C-Associated Cirrhosis¶
Authors: Shepard R et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Oct 09
DOI: 10.3390/microorganisms14102296 | PMID: 42943535
TL;DR: 加州10名HCV相關肝硬化合併coccidioidomycosis患者中，半數住院、3人出現中樞神經、骨或皮膚軟組織播散。復發者皆未於診斷前接受HCV治療；診斷前達SVR的2人均未復發，但此病例系列無法推論因果。
不嘻嘻：肝硬化遇上coccidioidomycosis，這關卡未免太多層。
Cryptococcosis After Initiation of Janus Kinase Inhibitors or Biologic DMARDs in Rheumatoid Arthritis: Three Pairwise Active-Comparator Analyses of Propensity Score-Matched TriNetX Cohorts, 2005-2025¶
Authors: Tay YX et al. | Journal: Pharmaceuticals (Basel) | Date: 2026 Oct 19
DOI: 10.3390/ph19101650 | PMID: 42943347
TL;DR: TriNetX配對世代顯示，JAKi相較TNFi及non-TNF bDMARDs，新發cryptococcosis風險約增2倍（HR 2.20、2.15），但各組10年累積機率均低於0.2%。事件僅20–22例且CI寬，殘餘confounding使因果結論受限。
不嘻嘻：JAKi的罕見風險，偏偏是令人不敢漏看的那種。
Virological Events During Immune Checkpoint Inhibitor Therapy: A Multi-Source Evaluation¶
Authors: Cao Y et al. | Journal: Pharmaceuticals (Basel) | Date: 2026 Oct 12
DOI: 10.3390/ph19101616 | PMID: 42943313
TL;DR: 20萬699筆ICI不良事件報告中，僅HBV reactivation達預設訊號（226例；ROR 1.20，95% CI 1.06–1.37），但改用腫瘤限定比較後不再成立。198篇文獻與164項試驗顯示，病毒風險評估及監測仍不足，應依情境判讀HBV、CMV與EBV。
不嘻嘻：ICI與病毒的帳還沒算清，監測先別省了。
Grafting of Black Pepper onto Native Piper Species¶
Authors: Cerri Neto B et al. | Journal: Plants (Basel) | Date: 2026 Oct 14
DOI: 10.3390/plants15203133 | PMID: 42943086
TL;DR: 黑胡椒嫁接試驗比較3種砧木，4個月後以Piper caldense為砧木者存活率最高，且water use efficiency高於Piper aduncum。P. caldense整體呈現較多相容特徵，可能適合作為bragantina黑胡椒砧木。
嘻嘻：黑胡椒找到好砧木，香料界也有最佳拍檔。
Adjunctive Low-Level Laser Therapy and Deep Oscillation in Pulmonary Rehabilitation for Post-Tuberculosis Lung Disease¶
Authors: Piciorea MV et al. | Journal: Life (Basel) | Date: 2026 Oct 08
DOI: 10.3390/life16101682 | PMID: 42942268
TL;DR: 65名PTLD患者接受8週復健；加用LLLT及deep oscillation組較單純kinesiotherapy組，EUROHIS-QOL-8增加6.46分、6MWD增加14.69 m，mMRC降低1.04分（均q＜0.001）。但非隨機且合併介入設計，僅能支持相關性。
嘻嘻：PTLD復健有曙光，但先別把相關性當魔法。
Changes in Tacrolimus and Everolimus Trough Concentrations and Dose Requirements After Initiation and Discontinuation of Letermovir Prophylaxis in Kidney Transplant Recipients: A Single-Center Retrospective Study¶
Authors: Uchida J et al. | Journal: J Clin Med | Date: 2026 Oct 13
DOI: 10.3390/jcm15207875 | PMID: 42941390
TL;DR: 20名腎移植受者開始letermovir後，tacrolimus與everolimus谷濃度分別增加約40–60%及35–50%，需減量約45%及30–40%。停藥後第7日濃度降至基準57.4%及65.9%，應在開始與停用時密集therapeutic drug monitoring。
不嘻嘻：letermovir一進一退，免疫抑制劑濃度跟著坐雲霄飛車。
Systemic Medication Adjustment and Short-Term Relapse of Cytomegalovirus Retinitis After Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation: A Research Communication¶
Authors: Wu S et al. | Journal: Biomedicines | Date: 2026 Sep 28
DOI: 10.3390/biomedicines14102189 | PMID: 42939995
TL;DR: 44名allo-HSCT後CMVR患者追蹤3個月，65眼中24眼復發；systemic medication adjustment與復發相關（HR 8.254，95% CI 2.656–25.645），time-dependent分析HR為11.360。13名調整後復發者，調整至復發中位間隔15日。
不嘻嘻：調整全身用藥後兩週就復發，CMVR真會挑時機。
Adoptive Virus-Specific T Cell Therapy for Viral Infections After Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation: Current Strategies and Future Perspectives¶
Authors: Weissinger EM et al. | Journal: Biomolecules | Date: 2026 Oct 08
DOI: 10.3390/biom16101465 | PMID: 42939718
TL;DR: 病毒特異性T cell adoptive transfer可在allo-HSCT後重建CMV、EBV、AdV等病原的免疫反應，並降低GvHD風險。現有證據聚焦療效、持續性與安全性，但產品標準化、即時可近性及與抗病毒預防整合，仍限制臨床普及。
嘻嘻：借來的病毒特異性T cell，或許能替移植後免疫補位。
Is PET/CT Useful in Detecting Pneumocystis jirovecii Colonization in Patients with Primary Lung Cancer?¶
Authors: Nowicki M et al. | Journal: Cancers (Basel) | Date: 2026 Oct 11
DOI: 10.3390/cancers18203274 | PMID: 42938811
TL;DR: 107名原發性肺癌手術患者中，12人（11.21%）有Pneumocystis jirovecii colonization，FDG PET/CT原發病灶SUVmax與未colonization者無差異（10.38 vs 8.86，p＝0.411）。配對後colonization組腫瘤最大徑較小，但不支持其影響術前代謝分期。
不嘻嘻：PET/CT這次沒抓到 P. jirovecii，不是每件事都能發光。
Toward a National Tuberculosis Lateral-Flow Urine Lipoarabinomannan (LF-LAM) External Quality Assessment Program in Thailand: Feasibility Demonstration Through Panel Development, Validation, and Proficiency Testing, March 2025-April 2026¶
Authors: Suparak S et al. | Journal: Diagnostics (Basel) | Date: 2026 Oct 13
DOI: 10.3390/diagnostics16203323 | PMID: 42938163
TL;DR: 泰國於2025–2026年建立尿液TB LF-LAM全國EQA/IQC，EQA通過率由2025年首輪83.3%升至2026年末輪98.4%（p＜0.05）。針對Grade 1 band誤判與判讀時間偏差再訓練後，使用者相關false-positive降至0%。
嘻嘻：把LF-LAM判讀練穩，TB篩檢少走不少冤枉路。
🟢 One Health / Zoonoses¶
Early-life bovine respiratory virome analysis reveals phage-driven adaptation and cross-host evolutionary signatures¶
Authors: Wang Y et al. | Journal: Nat Commun | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1038/s41467-026-77597-8 | PMID: 42946708
TL;DR: 牛犢上呼吸道 virome 在出生至斷奶期間豐富度與周轉率增加，temperate phages 為主；首週後出現 vertebrate-associated viruses，並重組出介於牛與人病毒譜系間的 CoV-D180、AdV-D56。
嘻嘻：牛犢鼻腔竟像病毒進化實驗室，值得繼續盯梢。
Viral metagenomics reveals heterogeneity in mammalian virus hosting, sharing, and spillover¶
Authors: Wang Y et al. | Journal: Proc Natl Acad Sci U S A | Date: 2026 Nov 03
DOI: 10.1073/pnas.2610672123 | PMID: 42945246
TL;DR: 分析4,685份 metagenomic datasets、296種哺乳類後，carnivores 攜帶 human-associated viruses 的傾向顯著較高，bats 排名較低；壽命與都市土地利用是病毒豐富度及傳播中心性的關鍵驅動因子。
嘻嘻：蝙蝠終於不是每次 spillover 都先背鍋。
Enterocin-capped CuZn bimetallic nanoparticles as an innovative strategy to control Salmonella in food safety systems¶
Authors: Nogueira MH et al. | Journal: Food Chem | Date: 2026 Oct 25
DOI: 10.1016/j.foodchem.2026.151752 | PMID: 42945879
TL;DR: 以 Enterococcus durans MF5 enterocin 製備的 Bio-CuZnNPs，對 Salmonella serovars MIC為0.5–32 mg mL-1，time-kill assays 最多降低6 log CFU mL-1，並抑制 biofilm及造成細胞膜損傷。
嘻嘻：讓 bacteriocin 帶著金屬去拆 biofilm，頗有巧思。
Nipah Virus (NiV) in Focus: Molecular Insights Into Pathogenesis, Transmission Dynamics, and Evolving Epidemiology From Malaysia to Recent Indian Outbreaks¶
Authors: Joon N et al. | Journal: Rev Med Virol | Date: 2026 Nov
DOI: 10.1002/rmv.70221 | PMID: 42947410
TL;DR: NiV流行病學已由馬來西亞豬隻相關傳播，轉為與 Pteropus fruit bats、受污染食物及密切人際接觸相關的反覆 spillover；已知outbreak case fatality為40%–100%，目前尚無人用核准疫苗。
不嘻嘻：致死率這麼高還沒疫苗，NiV 真是壓力測試。
Understanding lymphatic filariasis risk in endemic regions: Associations with preventive behaviours, environmental factors, and other mosquito-borne diseases¶
Authors: Saputra YA et al. | Journal: One Health | Date: 2026 Dec
DOI: 10.1016/j.onehlt.2026.101614 | PMID: 42936366
TL;DR: 印尼SKI 2023共520,505人，自述 lymphatic filariasis盛行率1.9%；0–17歲、未監督MDA與不良衛生設施提高勝算，規律服用 anti-filarial drug超過3年則降低風險（aOR 0.83）。
嘻嘻：長期 MDA 還是有用，公衛基本功沒有白練。
A blueprint for Vibrio surveillance and risk reduction in Europe¶
Authors: Higginson A et al. | Journal: One Health | Date: 2026 Dec
DOI: 10.1016/j.onehlt.2026.101604 | PMID: 42936307
TL;DR: 海表溫度上升與極端天氣正擴大歐洲 Vibrio 適生環境，波羅的海與北海已有熱浪相關outbreak；亟需整合環境監測、genomic epidemiology surveillance及風險溝通，以保護沿岸社區與海鮮安全。
不嘻嘻：海水變暖，Vibrio 的渡假版圖倒是先擴張了。
Epidemiology of animal bites and post-exposure vaccination coverage in Davao City, Philippines: A five-year retrospective cohort study, 2019-2023¶
Authors: Hinay AA et al. | Journal: One Health | Date: 2026 Dec
DOI: 10.1016/j.onehlt.2026.101622 | PMID: 42935849
TL;DR: 菲律賓達沃市2019–2023年共98,442例動物咬傷，狗佔63.5%、貓佔36.4%且皆增加；tissue culture vaccine覆蓋率維持100%，equine rabies immunoglobulin由18.5%升至85.9%。
嘻嘻：暴露後處置覆蓋率漂亮，至少狂犬病沒有可乘之機。
Whole genome-based characterization of virulence and antimicrobial resistance determinants in clinical Campylobacter jejuni isolates from Minnesota, 2018-2021¶
Authors: Hwang H et al. | Journal: J Clin Microbiol | Date: 2026 Oct 27
DOI: 10.1128/jcm.00514-26 | PMID: 42937302
TL;DR: 明尼蘇達州2,783株臨床 Campylobacter jejuni 中，tetracycline及quinolone表現型抗藥率分別為52.3%與30.7%；29%帶有quinolone resistance相關 gyrA mutation，WGS與表現型多數一致但有24處差異。
不嘻嘻：C. jejuni 的抗藥性很有主見，腸胃炎也不肯單純。
Surveillance of West Nile virus infections in humans and animals in Europe, monthly report - data submitted up to 7 October 2026¶
Authors: | Journal: EFSA J | Date: 2026 Oct
DOI: 10.2903/j.efsa.2026.10410 | PMID: 42936548
TL;DR: 歐洲2026年WNV season影響範圍及人類病例、動物outbreak數均創歷來新高，但無人類疾病嚴重度增加跡象；義大利病例及鳥類outbreak最多，希臘與法國人類病例、法國 equid outbreak皆創紀錄。
不嘻嘻：WNV 創紀錄的方式不太討喜，蚊子今年很有存在感。
Laboratory performance of antimicrobial susceptibility testing for GLASS pathogens among participants in the EQuAfrica programme, 2021‒2025¶
Authors: Perovic O et al. | Journal: PLOS Glob Public Health | Date: 2026
DOI: 10.1371/journal.pgph.0007478 | PMID: 42945389
TL;DR: EQuAfrica 2021–2025年EQA中，平均85% enrolled laboratories回報結果，organism ID平均得分83%、AST為73%；vancomycin與cefoxitin對 staphylococci 的critical AST errors具臨床治療風險，但整體表現隨時間改善。
嘻嘻：AST 品質會進步，臨床判讀才不必靠祈禱。
The genomic diversity of Salmonella Enteritidis from poultry and human clinical cases in Israel¶
Authors: Perry J et al. | Journal: Microb Genom | Date: 2026 Oct
DOI: 10.1099/mgen.0.001878 | PMID: 42944735
TL;DR: 以WGS分析以色列2019–2022年48株家禽及29株人類 Salmonella Enteritidis，主要clade I與IV分別接近全球Atlantic、Global lineage，支持家禽與人類共享傳播；fluoroquinolone resistance gyrA mutations見於人類6.9%、家禽10.4%。
不嘻嘻：家禽與人的 S. Enteritidis 看來共享同一張餐桌。
Characterization of a Salmonella Phage-Derived Endolysin LysSPYS2 and Its Combined Activity with Polymyxin B and Magnolol¶
Authors: Song Y et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Oct 21
DOI: 10.3390/microorganisms14102407 | PMID: 42943645
TL;DR: LysSPYS2對 Salmonella enterica serovar Typhimurium在42°C、pH 7有最高裂解活性，對多種 Gram-negative bacteria亦有效但偏向 Salmonella；完整細胞中單用抑制有限，合併 polymyxin B或magnolol可增強效果。
嘻嘻：endolysin 找到幫手後，終於能穿透 Gram-negative 的門檻。
Emergence of NDM-5-Positive Salmonella enterica Serovar Typhimurium Monophasic Variant ST34 in Hong Kong During 2020-2025¶
Authors: Tse AC et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Oct 08
DOI: 10.3390/microorganisms14102289 | PMID: 42943528
TL;DR: 香港2020–2025年4,404株non-typhoidal Salmonella 中14株（0.3%）為CR-NTS；13株皆NDM-positive，6株為帶 blaNDM-5的 Salmonella enterica serovar Typhimurium monophasic variant ST34，可能與中國大陸株及進口食品相關。
不嘻嘻：NDM-5 跑進食源性 Salmonella，餐桌也得提高警覺。
Food- and Waterborne Bacteria Transmission and Antimicrobial Resistance Under Climate Change: Evidence Gaps in Mainland Portugal¶
Authors: Borges M et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Oct 03
DOI: 10.3390/microorganisms14102231 | PMID: 42943470
TL;DR: 葡萄牙本土證據顯示升溫可能促進食源性與水源性病原生長並改變季節性，暴雨、洪水與乾旱則增加糞便污染及暴露途徑；連結氣候變數、AMR與genomic資料的研究仍有限，需建立climate-informed One Health surveillance。
不嘻嘻：氣候變遷替病原鋪路，監測資料卻還在補課。
Biofilm-Forming and Multidrug-Resistant Salmonella Thompson Strains Isolated from Edible Cipangopaludina cathayensis: An Emerging Food Safety Concern in Southern China¶
Authors: Li Y et al. | Journal: Microorganisms | Date: 2026 Oct 02
DOI: 10.3390/microorganisms14102229 | PMID: 42943468
TL;DR: 中國南方食用 Cipangopaludina cathayensis 分離的7株 Salmonella Thompson均對至少1種抗菌藥物抗藥，2株（28.6%）為MDR、5株（71.4%）形成biofilm；biofilm-forming C6469在小鼠造成肝壞死與腸損傷。
不嘻嘻：MDR S. Thompson 還會 biofilm，田螺也不能安心吃了。
資料來源：PubMed (articles retrieved 2026-10-28)