Daily Journal Digest — 2026-10-29¶
過去 24 小時新增：Transplant ID × 9、One Health × 13，共 22 篇。
⭐ 今日亮點¶
- Impact of ESKAPE pathogens on the One Health framework considering epidemiology and environmental occurrence
ESKAPE 與 One Health AMR 的跨域整合框架。 - Beyond microbiology: sociocultural, governance and economic determinants of foodborne outbreaks-lessons from the 2026 cyclosporiasis outbreak in the United States
以大型疫情重建食源性防疫的系統盲點。 - Burkholderia pseudomallei and Melioidosis in Mainland Southeast Asia: A Regional Synthesis of Ecological, Epidemiological, and Public Health Perspectives
串連氣候、環境與跨境 melioidosis 防治。
🔬 深入評讀¶
Impact of ESKAPE pathogens on the One Health framework considering epidemiology and environmental occurrence¶
Microbiol Mol Biol Rev | IF 9.5 | DOI | PMID 42949286
- 設計：敘述性綜述，結構化整合 ESKAPE pathogens 的抗藥機制、流行病學、臨床衝擊與 One Health 防治策略文獻及監測報告。
- 樣本：未報告系統性檢索範圍、納入研究數或研究年代；涵蓋人類醫療、動物與環境 reservoirs 的證據。
- 關鍵論點：ESKAPE pathogens 持續是 healthcare-associated infections 的主要病原，且在非臨床動物與環境 reservoirs 中愈常被檢出。作者主張 multidrug-resistant lineages 擴張、resistance determinants 跨部門傳播及監測整合不足，需將 surveillance、antimicrobial stewardship、感染預防與新療法研發置於同一 One Health 架構。
- Limitation：未說明系統性檢索、納入與排除準則或正式風險偏倚評估；跨部門資料的監測方法與病原定義異質性高，無法量化 reservoirs 間傳播的因果貢獻。
- Bottom line：面對 ESKAPE AMR，臨床院感策略應主動連結動物與環境監測，而非只在醫院內處理抗藥問題。
Beyond microbiology: sociocultural, governance and economic determinants of foodborne outbreaks-lessons from the 2026 cyclosporiasis outbreak in the United States¶
Clin Microbiol Infect | IF 8.0 | DOI | PMID 42951106
- 設計：以 2026 年美國 processed iceberg lettuce 相關 cyclosporiasis outbreak 為主軸的敘述性、解釋性綜述；作者以可重現的廣泛及事件特異 PubMed、Embase 檢索至 2026 年 10 月 16 日，並補充公衛與監管網站資料。
- 樣本：疫情共 12,883 例 laboratory-confirmed illnesses、570 例住院及 2 例死亡；文獻篩選旨在納入可提供不同機制或脈絡教訓的報告，未報告最終納入篇數。
- 關鍵論點：流行病學與 traceback 均指向 processed iceberg lettuce 及墨西哥中部單一供應商，雖一件產品檢體後被重新分類為 false positive，後續現場採樣仍在加工廠外排廢水與涉案種植者排水溝檢出 Cyclospora。作者指出，當產品檢驗陰性或不可得時，匯聚的流行病學與 traceback 證據仍可支持相稱管制；歸因變化、商業誘因、食品不安全與宿主脆弱性均會塑造疫情辨識與控制。
- Limitation：此為目的性選取案例的解釋性架構，並非經驗驗證的因果模型；污染途徑未釐清，且未提供正式風險偏倚評估或可比較的效果量。
- Bottom line：食源性疫情決策應清楚分開呈現流行病學、traceback 與實驗室證據，並在證據演變時透明調整風險溝通與管制。
Burkholderia pseudomallei and Melioidosis in Mainland Southeast Asia: A Regional Synthesis of Ecological, Epidemiological, and Public Health Perspectives¶
Transbound Emerg Dis | IF 2.6 | DOI | PMID 42952242
- 設計：敘述性區域綜述，整合東南亞大陸 Burkholderia pseudomallei 的生態分布、流行病學、動物感染、實驗室量能與公衛政策資料。
- 樣本：涵蓋柬埔寨、寮國、緬甸、馬來半島、越南等東南亞大陸地區；未報告系統性檢索策略、納入研究數或統合分析。
- 關鍵論點：作者指出 B. pseudomallei 可在稻田灌溉水、運河、河流、瀑布、飲用水源與觀賞魚缸檢出，土壤可檢出至 3 m 深。洪水、海嘯與豪雨與 melioidosis 發生增加相關；多國尚未將 melioidosis 列為法定通報疾病，緬甸缺乏全國指引，馬來半島僅有州級指引，支持環境、動物與人類感染整合監測及跨境合作。
- Limitation：敘述性回顧未提供研究納入流程、風險偏倚評估或可量化的氣候暴露效應量；環境檢出與人類感染間的因果鏈仍易受採樣密度、診斷量能與通報完整度影響。
- Bottom line：在氣候極端事件增加的情境下，melioidosis 防治應把環境監測、實驗室診斷與跨境通報視為同一套 One Health 能力。
🔴 Transplant & Opportunistic Infections¶
Multi-omics reveals evolution from CD7-negative T cell dysregulation to EBV-positive LPD after CD7 CAR-T therapy¶
Authors: Huang M et al. | Journal: Blood | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1182/blood.2026034648 | PMID: 42950083
TL;DR: CD7 CAR-T 後，CD7-negative T cells 對 EBV 抗病毒活性受損；Macro_IDO1 聚集形成免疫抑制微環境，促使 EBV 感染 B cells、plasmacytic differentiation 與惡性轉化。
不嘻嘻：CAR-T 後連 EBV 都來補刀，免疫重建真是步步驚心。
Real-World Use of Rezafungin for the Treatment of Challenging Aspergillus Infections¶
Authors: Stone N et al. | Journal: Mycoses | Date: 2026 Nov
DOI: 10.1111/myc.70230 | PMID: 42952321
TL;DR: 8 名難治性 Aspergillus infections 成人每週使用 rezafungin，多數曾對 triazole 治療失敗或不耐受；多數獲臨床／影像改善或疾病穩定，且耐受性良好，支持其作為 OPAT 選項。
嘻嘻：難纏的 Aspergillus 也有 OPAT 備案，臨床終於多一張牌。
Prognostic Value of the Delta Neutrophil Index for Predicting 28-Day Mortality in Intensive Care Unit Patients with Candidemia¶
Authors: Caliskan DK et al. | Journal: Med Mycol | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1093/mmy/myag116 | PMID: 42949725
TL;DR: 246 名 ICU candidemia 病人中，28 日死亡率為 46.3%；DNI 於採血培養時 AUC 最高僅 0.625，cutoff 2.4 的敏感度 43.0%、特異度 82.6%，校正 Candida species 與抗黴菌治療後不再顯著。
不嘻嘻：candidemia 死亡率依舊凶猛，這指標卻沒能救場。
Integrating knowledge graphs and retrieval-augmented generation to identify clinical pharmacology gaps in infectious disease trial protocols¶
Authors: Waikar S et al. | Journal: Front Pharmacol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fphar.2026.1955011 | PMID: 42952574
TL;DR: 以 42 項感染症試驗建立的 KG 含 223 nodes、376 edges；TB protocols 的 hepatic impairment exclusion 多於 PK studies，整合 KG-RAG 可辨識 trial protocols 的 clinical pharmacology reporting gaps。
嘻嘻：KG-RAG 開始抓 trial 漏洞，protocol 審稿人可以喘口氣。
Gemcitabine and oxaliplatin with or without rituximab in relapsed or refractory post-transplant lymphoproliferative disorder following renal transplantation: a single centre experience¶
Authors: Lennie C et al. | Journal: Leuk Lymphoma | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1080/10428194.2026.2740286 | PMID: 42952267
TL;DR: （待補摘要 — 需登入取得全文）
Enteric infections as HIV indicator conditions for HIV testing: An umbrella review¶
Authors: Rabuszko L et al. | Journal: HIV Med | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1111/hiv.70327 | PMID: 42952029
TL;DR: 納入 15 篇文獻、207 篇研究與 10,032 名 MSM；所有 faeco-oral sexually transmissible enteric infections 皆見 HIV 感染者，hepatitis A 個案亦有新診斷 HIV，支持將此類感染作為 HIV 與其他 STI 篩檢指標。
嘻嘻：腸胃炎也能成為 HIV 篩檢提醒，別再只盯著腸子。
Host-specific fungal target detection by triplex PCR with contemporaneous EBV and HCMV testing¶
Authors: Wang Y et al. | Journal: Diagn Microbiol Infect Dis | Date: 2026 Oct 23
DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2026.117703 | PMID: 42950441
TL;DR: 5,724 次 fungal triplex PCR 中 23.1% 檢出 fungal target；332 人分析顯示 AIDS 與 transplantation 的任一 fungal target 檢出勝算分別為 aOR 7.64、6.50，單憑 molecular detection 不足以診斷 active fungal disease。
不嘻嘻：PCR 陽性不等於發病，臨床判讀還是不能外包。
Monoclonal antibodies targeting Candida cell wall and cell-surface antigens: a systematic review¶
Authors: Kamran M et al. | Journal: J Mycol Med | Date: 2026 Oct 24
DOI: 10.1016/j.mycmed.2026.101664 | PMID: 42950376
TL;DR: 系統性回顧納入 12 項研究，辨識 10 類 Candida cell wall targets；mAbs 可經 opsonophagocytosis、biofilm inhibition 等作用提供保護，Mycograb 是唯一進入 Phase III 評估的 passive mAb。
嘻嘻：Candida 的 cell wall 終於有人認真開發新武器。
Antibiofilm and intracellular activity of manganese tetraphenyl porphyrin targeting nontuberculous mycobacterial manganese/heme metabolism¶
Authors: Narayanasamy P et al. | Journal: Biosci Rep | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1042/BSR20260634 | PMID: 42949197
TL;DR: MnTP 對 Mycobacteroides abscessus 與 M. avium 具低 MIC，能抑制及破壞 biofilm、降低胞內 M. abscessus 生長；hemin 可救回毒性，提示其作用涉及 Mn/heme metabolism 與 ROS 累積。
嘻嘻：NTM biofilm 有新破口，MnTP 值得繼續追。
🟢 One Health / Zoonoses¶
Impact of ESKAPE pathogens on the One Health framework considering epidemiology and environmental occurrence¶
Authors: Silva C et al. | Journal: Microbiol Mol Biol Rev | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1128/mmbr.00145-26 | PMID: 42949286
TL;DR: 文獻整合指出 ESKAPE pathogens 除為 healthcare-associated infections 主因，也持續在動物與環境 reservoirs 檢出；multidrug-resistant lineages 擴張及跨部門 resistance determinants 傳播，凸顯 One Health 整合監測與 stewardship 的必要性。
不嘻嘻：ESKAPE 到處流竄，One Health 不能只剩口號。
Beyond microbiology: sociocultural, governance and economic determinants of foodborne outbreaks-lessons from the 2026 cyclosporiasis outbreak in the United States¶
Authors: Gupta N et al. | Journal: Clin Microbiol Infect | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1016/j.cmi.2026.10.022 | PMID: 42951106
TL;DR: 美國 2026 年 processed iceberg lettuce 相關 cyclosporiasis outbreak 共 12,883 例確診、570 例住院、2 例死亡；epidemiology 與 traceback 指向墨西哥中部單一供應商，但污染途徑仍未釐清。
不嘻嘻：一顆生菜牽出萬人疫情，供應鏈又讓人胃痛。
Listeria monocytogenes favors the vacuolar compartment during ex vivo human placental infections¶
Authors: McLeod PA et al. | Journal: mBio | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1128/mbio.01704-26 | PMID: 42949276
TL;DR: ex vivo human placenta 中，少於 1% L. monocytogenes 與 actin-rich structures 相關；39% 位於 Rab5-positive、44% 位於 Lamp1-positive vacuoles，顯示其主要在非酸化、非降解性 LCVs 內複製。
嘻嘻：Listeria 的胎盤藏身術被看穿，機制拼圖又補上一角。
Functional analysis of non-muscle myosin heavy chain IIA (amino acids 1831-1882) in facilitating pseudorabies virus entry via interaction with glycoproteins gH and gL¶
Authors: Wang L et al. | Journal: J Virol | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1128/jvi.01432-26 | PMID: 42949293
TL;DR: 抑制、knockdown NMHC IIA 或使用 sPRA／anti-sPRA serum，均 dose-dependently 降低 PRV 感染；NMHC IIA C-terminus aa 1831-1882 與 gH/gL 結合，促進 viral internalization。
嘻嘻：PRV 入侵找到宿主把手，阻斷策略有了著力點。
Whole genome sequencing and comparative genomic characteristics analysis of three strains of Aerococcus urinaeequi from swine¶
Authors: Wang H et al. | Journal: BMC Microbiol | Date: 2026 Jul 31
DOI: 10.1186/s12866-026-05466-x | PMID: 42946981
TL;DR: 3 株豬源 multidrug-resistant Aerococcus urinaeequi 均具 tetM、optrA 與 repUS43-type plasmid replicon；23 株資料集中 optrA 檢出率 39%，僅 AU3 在試驗條件下形成可檢出的 biofilm。
不嘻嘻：豬源菌也帶著 optrA 上場，抗藥性從不挑物種。
A putative GtrB-like glycosyltransferase modulates cation-dependent BCP8-2 phage infection and cell surface structure in Bacillus cereus¶
Authors: Asare PT et al. | Journal: Appl Environ Microbiol | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1128/aem.00824-26 | PMID: 42949265
TL;DR: Bacillus cereus gtrB mutant BC2012 對 BCP8-2 呈部分抗性，phage adsorption 與 infectivity 在 cation-rich conditions 明顯下降；complementation 可恢復敏感性，並伴隨較薄、平滑的 cell wall。
嘻嘻：phage 感染的門鎖更清楚了，工程化空間正在打開。
Comparative genome analysis of Corynebacterium ulcerans isolates obtained in Japan¶
Authors: Kimura M et al. | Journal: Microbiol Spectr | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1128/spectrum.01723-26 | PMID: 42949292
TL;DR: 比較 106 株日本與 597 株公開 isolates，Corynebacterium ulcerans 日本株 ST 337 占 69.0%、在歐洲罕見；SNV analysis 支持部分 human cases 存在 companion animals 至人類的 zoonotic transmission。
不嘻嘻：寵物與人共享菌株，zoonosis 的邊界又更模糊。
Predicted spatial distribution of the primary Lassa virus reservoir, the multimammate mouse, in Africa¶
Authors: Lateef AM et al. | Journal: Front Public Health | Date: 2026
DOI: 10.3389/fpubh.2026.1916488 | PMID: 42947819
TL;DR: 最大熵模型預測 Mastomys natalensis 適生區廣布撒哈拉以南非洲，集中於西、中、東非熱帶及副熱帶帶；奈及利亞南部與中部適生性高，往鄰近薩赫勒的北部漸降。
不嘻嘻：宿主地圖越清楚，防疫待辦越長。
Shotgun Metagenomic Profiling of Phlebotomus papatasi (Diptera: Psychodidae, Phlebotomine) in Zoonotic Cutaneous Leishmaniasis Endemic Foci of Iraq: Microbiota, Resistome, and Virulome¶
Authors: Al-Joary YIMA et al. | Journal: Acta Trop | Date: 2026 Oct 28
DOI: 10.1016/j.actatropica.2026.108385 | PMID: 42950998
TL;DR: 伊拉克129隻吸血雌性 Phlebotomus papatasi 合併樣本的shotgun metagenomic定序，98.32%已分類reads為Proteobacteria，Enterobacter cloacae 占74.34%，另檢出約8.96% Wolbachia及AMR、virulence genes。
嘻嘻：小小沙蠅，竟藏著一整座微生物情報站。
Burkholderia pseudomallei and Melioidosis in Mainland Southeast Asia: A Regional Synthesis of Ecological, Epidemiological, and Public Health Perspectives¶
Authors: Oeurn K et al. | Journal: Transbound Emerg Dis | Date: 2026
DOI: 10.1155/tbed/5555905 | PMID: 42952242
TL;DR: 敘述性回顧指出 Burkholderia pseudomallei 在東南亞大陸水體、土壤及觀賞魚缸廣泛分布，土壤可檢出至3 m深；洪水、海嘯與豪雨可增加melioidosis發生，部分國家仍未列為法定通報疾病。
不嘻嘻：豪雨一來，melioidosis 又比通報系統更早到場。
Machine learning-assisted fluorescence immunochromatographic detection of Salmonella typhimurium in complex food matrices via tannic acid-enhanced AIE nanoprobes¶
Authors: Ji C et al. | Journal: Anal Chim Acta | Date: 2026 Dec 01
DOI: 10.1016/j.aca.2026.346293 | PMID: 42951531
TL;DR: tannic acid修飾STT nanoparticles使量子產率由12.91%升至30.51%，用於 Salmonella typhimurium ICA的視覺與定量偵測極限分別為500及128 CFU/mL；三種食品加標回收率82.75%–119.29%。
嘻嘻：食安快篩再亮一點，Salmonella 就更難躲。
Cross-validated SPR/SERS dual-mode fiber biosensor for rapid and accurate detection of Salmonella Typhimurium in foods¶
Authors: Zhu S et al. | Journal: Talanta | Date: 2026 Oct 23
DOI: 10.1016/j.talanta.2026.130818 | PMID: 42950634
TL;DR: SPR/SERS雙模式光纖biosensor於35分鐘內偵測 Salmonella Typhimurium；SPR線性範圍50–10^8 CFU/mL、LOD 16 CFU/mL，SERS為200–10^8 CFU/mL、LOD 65 CFU/mL，並可交叉驗證降低偽陽性。
嘻嘻：雙模式交叉把關，偽陽性終於沒那麼囂張。
Population pharmacokinetic model-based determination of enrofloxacin susceptibility breakpoints and dosing regimens for Salmonella in chickens¶
Authors: Sun L et al. | Journal: Poult Sci | Date: 2026 Sep 24
DOI: 10.1016/j.psj.2026.107767 | PMID: 42950477
TL;DR: 187株雞源 Salmonella 的enrofloxacin COWT為4 μg/mL；最終plasma與cecal contents susceptibility breakpoints分別為4及1 μg/mL，建議口服4.25–4.77 mg/kg、每日2次、連續3日。
嘻嘻：雞隻劑量有憑有據，抗藥性少一個練兵場。
資料來源：PubMed (articles retrieved 2026-10-29)